Betacoronavirus pandemicum

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SARS-assoziierte Coronaviren
SARS-CoV PHIL 6400
Systematik
Klassifikation: Viren Realm: Riboviria[2] Reich: Orthornavirae[1] Phylum: Pisuviricota[1] Klasse: Pisoniviricetes[1] Ordnung: Nidovirales[1] Unterordnung: Cornidovirineae[1] Familie: Coronaviridae[1] Unterfamilie: Orthocoronavirinae[1] Gattung: Betacoronavirus[1] Untergattung: Sarbecovirus[1] Art: Betacoronavirus pandemicum
Taxonomische Merkmale
Genom: (+)ssRNA linear Baltimore: Gruppe 4 Symmetrie: helikal Hülle: vorhanden
Wissenschaftlicher Name
Betacoronavirus pandemicum
Kurzbezeichnung
SARSr-CoV[3]
Links
NCBI Taxonomy: 694009 NCBI Reference: NC_004718.3 (SARS-CoV), NC_045512.2 (SARS-CoV-2) ViralZone (Expasy, SIB): 764 (Gattung) ICTV Taxon History: 201851868

Betacoronavirus pandemicum (früher Severe acute respiratory syndrome-related coronavirus) bezeichnet die bisher einzige vom International Committee on Taxonomy of Viruses (ICTV) offiziell bestätigte Spezies (Art) der Untergattung Sarbecovirus der Gattung Betacoronavirus in der Familie der Coronaviridae (Stand 7. Mai 2024).^[4][5] Geläufige Abkürzungen wie SARSr-CoV,^[3] englisch SARS-related coronavirus(es)^[3] oder deutsch „SARS-assoziierte(s) Coronavirus/-viren“ sind vom Speziesnamen abgeleitete sogenannte „Sammelbezeichnungen“ (englisch collective names).^[6]

Die Spezies wurde vom ICTV 2009 ratifiziert aus der Vereinigung den vorherigen Spezies Severe acute respiratory syndrome coronavirus und Severe acute respiratory syndrome-related bat coronavirus (einer Gruppe nahe verwandter Viren).^[7]

Die bekanntesten Vertreter dieser Spezies sind SARS-CoV(-1) und SARS-CoV-2,^[8] die die Erkrankungen SARS bzw. COVID-19 auslösen.

Name[Bearbeiten | Quelltext bearbeiten]

Bis 2009 existierte die Spezies als Severe acute respiratory syndrome coronavirus, welche nur Viren enthielt, die mit dem SARS-Ausbruch 2003 in Verbindung standen, nebst einer Reihe praktisch identischer Virus-Isolate von Tieren. 2008 wurde vorgeschlagen, weitere weiter entfernt verwandte, neu entdeckte Fledermausviren (29 an der Zahl) zur Spezies hinzuzunehmen, die große genetische Übereinstimmungen (bis zu 97 % in Schlüsselbereichen) mit den Viren der bisherigen Spezies hatten. Darunter befanden sich z. B. SARS-Rh-BatCoV HKU3, SARSr-Rh-BatCoV und SARSr-Rh-BatCoV 273.^[7]

Daraufhin wurde die Spezies Severe acute respiratory syndrome coronavirus mit der Gruppe von neuen, sehr ähnlichen Fledermausviren, genannt Severe acute respiratory syndrome-related bat coronavirus oder „SARS-related Rhinolophus BatCoV“, zur neuen Spezies Severe acute respiratory syndrome-related coronavirus vereint. Im Rahmen dessen wurde auch die neue Unterfamilie Coronavirinae in der Familie Coronaviridae gebildet, und aus der vorherigen Gattung Coronavirus die neuen Gattungen Alpha-, Beta- und Gammacoronavirus (aus den vorherigen Phylogruppen 1, 2 respektive 3 der vorherigen Gattung).^[1][7]

Die Regeln des International Committee on Taxonomy of Viruses (ICTV) zur Virustaxonomie geben vor, dass Spezies-Namen weder abgekürzt noch in andere Sprachen übersetzt werden sollen. Daher sind die geläufigen Abkürzungen wie „SARSr-CoV(s)“ und „SARS-related coronavirus(es)“ keine (international offiziellen) Alternativ-Bezeichnungen der Spezies, sondern zulässige, gebräuchliche Sammelbezeichnungen für einzelne oder alle Viren in dieser Spezies.^[6]

Mit schrittweisen der Einführung binärer Namen für Virus-Spezies durch das ICTV bekam die Art im April 2024 schließlich die neue binäre Bezeichnung Betacoronavirus pandemicum.^[1]

Systematik[Bearbeiten | Quelltext bearbeiten]

Zwar ist Betacoronavirus pandemicum (mit SARS-CoV und SARS-CoV-2) die derzeit (Stand 3. Juni 2024) einzige offiziell vom International Committee on Taxonomy of Viruses (ICTV) bestätigte Spezies in der Untergattung Sarbecovirus, in der Taxonomie das National Center for Biotechnology Information (NCBI) finden sich aber innerhalb dieser Untergattung eine Reihe vorgeschlagene Kandidaten, die dieser Spezies nicht zugeordnet sind. Die Systematik der Untergattung Sarbecovirus ist nach ICTV (Stand 7. Mai 2024), ergänzt um einige Vorschläge ach der NCBI-Taxonomie (Stand 3. Juni 2024) wie folgt:^{[4][5][9][10]}

Unterfamilie Orthocoronavirinae: Gattung Betacoronavirus

…

Untergattung Sarbecovirus^[4][11][9]

Spezies Betacoronavirus pandemicum [SARS-assoziierte Coronaviren, englisch Severe acute respiratory syndrome-related coronavirus, SARS-related coronavirus(es), SARSr-CoV, „Kenya bat coronavirus BtKY72“^[12]]^[3][10]

• Severe acute respiratory syndrome coronavirus^[5] [SARS coronavirus] (SARS-CoV,^[5] SARS-CoV-1) – Erreger von SARS^[13][14]

Subtyp Tor2^[5] – Referenz (englisch Exemplar)^[5][15]

Subtyp PC4-227^[5][16]

Subtyp SARS-CoV/SARS-CoV-2 RdRp – künstliche Mutante: ursprüngliches SARS-Virus SARS-CoV-1 mit ausgetauschtem RdRp-Gen von SARS-CoV-2)^[17]

• Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2^[5] [SARS coronavirus 2, 2019-novel Coronavirus, Wuhan seafood market pneumonia virus] (SARS-CoV-2,^[5] 2019-nCoV) – Erreger von COVID-19^[18][19][20]

Subtyp Wuhan-Hu-1^[5][21]

Subtyp Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 isolate SARS-CoV-2/human/ZAF/NHLS-UCT-LA-ZC45/2023 (Bat_SL-CoV_ZC45, bat-SL-CoVZC45),^[22][23]

• Severe acute respiratory syndrome-related coronavirus BtKY72 [Kenya bat coronavirus BtKY72] (SARSr-CoV BtKY72)

Subtyp BtKY72^[5][12]

• Rhinolophus affinis bat coronavirus RaTG13 [Bat coronavirus RaTG13] BatCoV-RaTG13, Bat_SL-CoV_RaTG13)^[24] – gefunden in Java-Hufeisennasen (Rhinolophus affinis, englisch intermediate horseshoe bat) in der chinesischen Provinz Yunnan^{[25][26][27][28]} (mit Gensequenz KP876546 zu BtCoV/4991 Polymerase)^[22]

• SARS-related betacoronavirus Rp3/2004 (Bt-SLCoV Rp3) – infiziert Rhinolophus sinicus^[29][30]

• Bat SARS coronavirus HKU3:^[28][31]

Subtyp Bat SARS coronavirus HKU3-3 (Bat_SL-CoV_HKU3-3)

Subtyp Bat SARS coronavirus HKU3-7 (Bat_SL-CoV_HKU3-7)

Subtyp Bat SARS coronavirus HKU3-12 (Bat_SL-CoV_HKU3-12)

• Civet SARS CoV SZ3/2003 (SARS-CoV SZ3) – infiziert Larvenroller^[32][33]

• Civet SARS CoV SZ16/2003 (SARS-CoV SZ16) – infiziert Larvenroller^[32][34]

• BtRs-BetaCoV/YN2013 (Bat_SL-CoV_YN2013)^[28][35]

• Bat coronavirus Rp/Shaanxi2011 (Bat_SL-CoV_Shaanxi2011)^[28][36]

• Bat coronavirus Cp/Yunnan2011 (Bat_SL-CoV_Yunnan2011)^[28][37]

• BtRs-BetaCoV/GX2013 (Bat_SL-CoV_GX2013)^[28][38]

• BtRs-BetaCoV/HuB2013 (Bat_SL-CoV_HuB2013)^[28][39]

• Bat SARS CoV Rm1/2004^[40]

Subtyp Bat CoV 279/2005 (Bat_SL-CoV_279)^[28]

• Bat SARS-like coronavirus isolate Rs4231 (Bat_SL-CoV_Rs4231)^[28][41]

• Bat SARS-like coronavirus isolate Rs4247 (Bat_SL-CoV_Rs4247)^[28][42]

• Bat SARS-like coronavirus isolate Rs7327 (Bat_SL-CoV_Rs7327)^[28][43]

• Bat SARS-like coronavirus isolate Rs9401 (Bat_SL-CoV_Rs9401)^[28][44]

• Bat SARS-like coronavirus isolate As6526 (Bat_SL-CoV_As6526)^[28][45]

• Severe acute respiratory syndrome-related coronavirus strain BtKY72 (Bat_SL-CoV_BtKY72)^[28]

• Bat SARS-like coronavirus YNLF_34C (Bat_SL-CoV_YNLF-34C)^[28][46]

• Bat SARS-like coronavirus isolate bat-SL-CoVZC45 (Bat_SL-CoV_ZXC21, bat-SL-CoVZXC21)^[22][47]

…

Spezies „Bat coronavirus BM48-31/BGR/2008“^[48]

• Bat_SL-CoV_BM48-31^[28]

Spezies „Bat coronavirus RacCS203“

Spezies „Bat coronavirus RacCS22“

Spezies „Bat coronavirus RacCS253“

Spezies „Bat coronavirus RacCS264“

Spezies „Bat coronavirus RacCS271“

Spezies „Bat SARS-like coronavirus Khosta-1“

Spezies „Bat SARS-like coronavirus Khosta-2“

Spezies „Bat SARS-like virus BtSY1“

Spezies „Bat SARS-like virus BtSY2“

Spezies „Betacoronavirus sp. RmYN05“

Spezies „Betacoronavirus sp. RmYN07“

Spezies „Betacoronavirus sp. RmYN08“

Spezies „Betacoronavirus sp. RpYN06“

Spezies „Betacoronavirus sp. RsYN03“

Spezies „Betacoronavirus sp. RsYN04“

Spezies „Betacoronavirus sp. RsYN09“

Spezies „Coronavirus BtRs-BetaCoV/YN2018A“

Spezies „Coronavirus BtRs-BetaCoV/YN2018B“^[49]

• Bat_SL-CoV_YN2018B^[28]

Spezies „Coronavirus BtRs-BetaCoV/YN2018C“^[50]

• Bat_SL-CoV_YN2018C^[28]

Spezies „Coronavirus BtRs-BetaCoV/YN2018D“

Spezies „Horseshoe bat sarbecovirus“

Spezies „Pangolin coronavirus“^[51] [Manis-CoV,^[52][18] pangolin SARS-like coronavirus, Pan_SL-CoV,^[53] Pangolin-CoV^[54]] – bei Schuppentieren

• Pangolin coronavirus isolate MP789 – aus der Metagenomik^[22][55]
• Klade Pan_SL-CoV_GX gefunden in Malaiischen Schuppentieren (Manis javanica, englisch Sunda pangolin, vom chinesischen Zoll in der Provinz Guangxi beschlagnahmt)^[28]

Subtyp Pan_SL-CoV_GX/P4L

Subtyp Pan_SL-CoV_GX/P2V^[56]

Subtyp Pan_SL-CoV_GX/P1E

Subtyp Pan_SL-CoV_GX/P5L

Subtyp Pan_SL-CoV_GX/P5E

Subtyp Pan_SL-CoV_GX/P3B

• Klade Pan_SL-CoV_GD gefunden in Malaiischen Schuppentieren (Manis javanica, englisch Sunda pangolin, vom chinesischen Zoll in der Provinz Guangdong beschlagnahmt)^[28]

Subtyp Pan_SL-CoV_GD/P1La

Subtyp Pan_SL-CoV_GD/P2S

Subtyp Pan_SL-CoV_GD/P1L^[19] mit den SRA^{[A. 1]} -Bezeichnern SRR10168374, SRR10168392, SRR10168376,^[57][18] SRR10168377^{[58][25][59][18]} und SRR10168378^{[60][25][59][18]}

Spezies „Pangolin coronavirus GZ5-2“^[61]

Spezies „Rhinolophus siamensis bat sarbecovirus“

Spezies „Sarbecovirus RhGB01“^[62]

• Bat coronavirus RhGB01 (BatCoV-RhGB01) – aus Metagenomanalysen bei der Kleinen Hufeisennase (Rhinolophus hipposideros) in Gloucestershire (England) und Wales.^[63]

Spezies „Sarbecovirus sp. RfGB01“

Spezies „Sarbecovirus sp. RfGB02“

Spezies „Sarbecovirus sp. RhGB07“

Spezies „Sarbecovirus sp. RhGB08“

Spezies „SARS-like coronavirus WIV16“^[64]

• Bat_SL-CoV_WIV16^[28]

Spezies „Bat coronavirus BetaCoV/Rm/Yunnan/YN02/2019“^[65]

• Bat coronavirus RmYN02 [Rhinolophus malayanus bat coronavirus RmYN02] (BatCoV-RmYN02)^[54] – gefunden in der Malaiischen Hufeisennase (R. malayanus).

ohne Zuordnung zu einer Spezies

• Sarbecovirus sp. isolate Anlong-112 (Bat_SL-CoV_Anlong-112)^[28]<ref<>NCBI: Sarbecovirus sp. isolate Anlong-112, … (Genbank: KY770859.1).</ref>

• Sarbecovirus sp. isolate SC2018B (Bat_SL-CoV_SC2018)^[28]

• Bat_SL-CoV_Rf9402^[28][66]

• Bat coronavirus RmYN01 (BatCoV-RmYN01 BetaCoV/Rm/Yunnan/YN01/2019)^[54]

• Bat_SL-CoV_Longguan^[28]

• Bat coronavirus Rc-o319 [Rhinolophus cornutus bat coronavirus Rc-o319] (BatCoV-Rc-o319) – gefunden im Kot von Horn-Hufeisennasen^[67] (Rhinolophus cornutus, englisch little Japanese horseshoe bat) in Japan^[68]

• …

…

Anm.:

Es ist nur eine Auswahl der wichtigsten Vertreter angegeben.

Der Referenzstamm der Spezies („Exemplar“) ist SARS-CoV mit Tor2^[5]

Anmerkungen[Bearbeiten | Quelltext bearbeiten]

1. ↑ NCBI Sequence Read Archive (SRA).

Einzelnachweise[Bearbeiten | Quelltext bearbeiten]

1. ↑ ^{a b c d e f g h i j k} ICTV: Sarbecovirus (2023 Release, MSL #39).
2. ↑ ICTV: ICTV Master Species List 2018b.v2. MSL #34, 31. Mai 2019 (englisch).
3. ↑ ^{a b c d} Ben Hu, Lei-Ping Zeng, Xing-Lou Yang, Xing-Yi Ge, Wei Zhang, Bei Li, Jia-Zheng Xie, Xu-Rui Shen, Yun-Zhi Zhang, Ning Wang, Dong-Sheng Luo, Xiao-Shuang Zheng, Mei-Niang Wang, Peter Daszak, Lin-Fa Wang, Jie Cui, Zheng-Li Shi: Discovery of a rich gene pool of bat SARS-related coronaviruses provides new insights into the origin of SARS coronavirus. In: Christian Drosten (Hrsg.): PLOS Pathogens. 30. November 2017, Erster Satz, doi:10.1371/journal.ppat.1006698 (englisch): “SARS-related coronaviruses (SARSr-CoV)” 
4. ↑ ^{a b c} ICTV: Taxonomy Browser. Stand: Master Species List (MSL) #39v2 vom 7. Mai 2024 (englisch).
5. ↑ ^{a b c d e f g h i j k l} ICTV: Virus Metadata Resource (VMR) #39v1 vom 17. Mai 2024 (≙ MSL #39v2).
6. ↑ ^{a b} How to write virus and species names? In: talk.ictvonline.org. International Committee on Taxonomy of Viruses (ICTV), 6. April 2020, archiviert vom Original (nicht mehr online verfügbar) am 9. Juni 2019; abgerufen am 7. Mai 2020 (englisch).  Info: Der Archivlink wurde automatisch eingesetzt und noch nicht geprüft. Bitte prüfe Original- und Archivlink gemäß Anleitung und entferne dann diesen Hinweis.@1@2Vorlage:Webachiv/IABot/talk.ictvonline.org 
7. ↑ ^{a b c} Proposal: 2008.085-126V. (PDF; 175 kB) In: talk.ictvonline.org. International Committee on Taxonomy of Viruses (ICTV), S. 37, abgerufen am 1. Juni 2024 (englisch). 
8. ↑ Alexander E. Gorbalenya, Susan C. Baker, Ralph S. Baric, Raoul J. de Groot, Christian Drosten, Anastasia A. Gulyaeva, Bart L. Haagmans, Chris Lauber, Andrey M Leontovich, Benjamin W. Neuman, Dmitry Penzar, Stanley Perlman, Leo L.M. Poon, Dmitry Samborskiy, Igor A. Sidorov, Isabel Sola, John Ziebuhr: Severe acute respiratory syndrome-related coronavirus: The species and its viruses – a statement of the Coronavirus Study Group. In: bioRxiv. 11. Februar 2020, bioRxiv: 10.1101/2020.02.07.937862v1 (Preprint-Volltext), S. 1–20, doi:10.1101/2020.02.07.937862 (englisch). 
9. ↑ ^{a b} NCBI Taxonomy Browser: Sarbecovirus, Details: Sarbecovirus (subgenus), mit unclassified Sarbecovirus.
10. ↑ ^{a b} NCBI Taxonomy Browser: Severe acute respiratory syndrome-related coronavirus, Details: Severe acute respiratory syndrome-related coronavirus (species).
11. ↑ ICTV: Betacoronavirus pandemicum (2023 Release, MSL #39).
12. ↑ ^{a b} Kenya bat coronavirus BtKY72 (species) im National Center for Biotechnology Information (NCBI)
13. ↑ Kristian G. Andersen, Andrew Rambaut, W. Ian Lipkin, Edward C. Holmes, Robert F. Garry: The Proximal Origin of SARS-CoV-2. Auf: virologica.org, Datenstand: 14. Februar 2020. Quelle: ARTIC Network (englisch).
14. ↑ Severe acute respiratory syndrome coronavirus im National Center for Biotechnology Information (NCBI)
15. ↑ SARS coronavirus Tor2 (no rank) im National Center for Biotechnology Information (NCBI)
16. ↑ SARS coronavirus PC4-227 (no rank) im National Center for Biotechnology Information (NCBI)
17. ↑ Andrea J. Pruijssers, Timothy P. Sheahan et al. Remdesivir inhibits SARS-CoV-2 in human lung cells and chimeric SARS-CoV expressing the SARS-CoV-2 RNA polymerase in mice. In: Cell Reports, Band 32, Nr. 3, 7. Juli 2020; doi:10.1016/j.celrep.2020.107940 (englisch). Dazu:
    • Tina Hesman Saey: Remdesivir ma​y work even better against COVID-19 than we thought. Auf: ScienceNews vom 13. Juli 2020.
18. ↑ ^{a b c d e} Chengxin Zhang, Wei Zheng, Xiaoqiang Huang, Eric W. Bell, Xiaogen Zhou, and Yang Zhang: Protein Structure and Sequence Reanalysis of 2019-nCoV Genome Refutes Snakes as Its Intermediate Host and the Unique Similarity between Its Spike Protein Insertions and HIV-1. In: Journal of Proteome Research. Band 19, Nr. 4. American Chemical Society, 22. März 2020, S. 1351–1360, doi:10.1021/acs.jproteome.0c00129 (englisch, Volltext [PDF; 7,1 MB; abgerufen am 6. Juni 2020] Halb kursiv gesetzt: Manis-CoV, scheinbar bzgl. Wirtstier-Typografie: Manis javanica): “2019-nCoV and the Manis coronavirus (Manis-CoV)”  Dazu:
    • PrePrint, PrePrint Volltext (PDF) vom 8. Februar 2020.
19. ↑ ^{a b} Tommy Tsan-Yuk Lam Na Jia Ya-Wei Zhang, Marcus Ho-Hin Shum Jia-Fu Jiang, Hua-Chen Zhu, Wu-Chun Cao et al.: Identifying SARS-CoV-2-related coronaviruses in Malayan pangolins. In: Nature, Band 583, 26. März 2020, S. 282–285; doi:10.1038/s41586-020-2169-0 (englisch). Dazu:
    • Tommy Tsan-Yuk Lam, Marcus Ho-Hin Shum, Hua-Chen Zhu, Yi-Gang Tong, Xue-Bing Ni, Yun-Shi Liao, Wei Wei, William Yiu-Man Cheung, Wen-Juan Li, Lian-Feng Li, Gabriel M. Leung, Edward C. Holmes, Yan-Ling Hu, Yi Guan: Identification of 2019-nCoV related coronaviruses 1 in Malayan pangolins in southern China. Auf: bioRxiv vom 18. Februar 2020, doi:10.1101/2020.02.13.945485 (Preprint, engl.).
20. ↑ Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 im National Center for Biotechnology Information (NCBI)
21. ↑ NCBI Nucleotide: txid2697049[Organism:noexp] AND Wuhan-HU-1.
22. ↑ ^{a b c d} Erwan Sallard, José Halloy, Didier Casane, Etienne Decroly, Jacques van Helden: Tracing the origins of SARS-COV-2 in coronavirus phylogenies (Retrouver les origines du SARS-COV-2 dans les phylogénies de coronavirus). In: Médecine/Sciences, Preprint vom 16. Juli 2020, ResearchGate:342735890 (englisch); [[HAL (offenes Archiv)|]]:hal-02891455v2 (16. Juli 2020, französisch); HAL:hal-02891455v8 (24. November 2020, engl.).
23. ↑ NCBI: Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 isolate SARS-CoV-2/human/ZAF/NHLS-UCT-LA-ZC45/2023, … (Genbank: OQ826158.1).
24. ↑ Bat coronavirus RaTG13 (no rank) im National Center for Biotechnology Information (NCBI)
25. ↑ ^{a b c} Alexandre Hassanin: Coronavirus Could Be a 'Chimera' of Two Different Viruses, Genome Analysis Suggests. Auf: science^alert vom 24. März 2020. Quelle: The Conversation (englisch).
26. ↑ Kristian G. Andersen, Andrew Rambaut, W. Ian Lipkin, Edward C. Holmes, Robert F. Garry: The Proximal Origin of SARS-CoV-2. In: NJature Medicine, Band 26, 17. März 2020, S. 450–452; [doi:10.1038/s41591-020-0820-9]], Datenstand: 11. März 2020 (englisch).
27. ↑ NCBI Taxonomy Browser: Bat coronavirus RaTG13 (no rank).
28. ↑ ^{a b c d e f g h i j k l m n o p q r s t u v w x y} Xiaojun Li, Elena E. Giorgi, Manukumar Honnayakanahalli Marichannegowda, Brian Foley, Chuan Xiao, Xiang-Peng Kong, Yue Chen, S. Gnanakaran, Bette Korber, Feng Gao: Emergence of SARS-CoV-2 through recombination and strong purifying selection. In: AAAS: Science Advances, Band 6, Nr. 27, 1. Juli 2020, eabb9153, doi:10.1126/sciadv.abb9153, Epub 29. Mai 2020 (englisch).
29. ↑ Dezhong Xu, Huimin Sun, Haixia Su, Lei Zhang; Jingxia Zhang, Bo Wang, Rui Xu: SARS coronavirus without reservoir originated from an unnatural evolution, experienced the reverse evolution, and finally disappeared in the world. In: Chinese Medical Journal. Band 127, Nr. 13, 5. Juli 2014, S. 2537–2542; doi:10.3760/cma.j.issn.0366-6999.20131328 (englisch).
30. ↑ SARS-related betacoronavirus Rp3/2004 (no rank) im National Center for Biotechnology Information (NCBI)
31. ↑ Bat SARS coronavirus HKU3 (no rank) im National Center for Biotechnology Information (NCBI)
32. ↑ ^{a b} Ming Wang et al. SARS-CoV Infection in a Restaurant from Palm Civet. In: Emerging Infectious Diseases journal. Band 11, Nr. 12, Dezember 2005, S. 1860–1865; doi:10.3201/eid1112.041293, PMC 3367621 (freier Volltext). PMID 16485471 (englisch).
33. ↑ Civet SARS CoV SZ3/2003 (no rank) im National Center for Biotechnology Information (NCBI)
34. ↑ Civet SARS CoV SZ16/2003 (no rank) im National Center for Biotechnology Information (NCBI)
35. ↑ BtRs-BetaCoV/YN2013 (no rank) im National Center for Biotechnology Information (NCBI)
36. ↑ Bat coronavirus Rp/Shaanxi2011 (no rank) im National Center for Biotechnology Information (NCBI)
37. ↑ Bat coronavirus Cp/Yunnan2011 (no rank) im National Center for Biotechnology Information (NCBI)
38. ↑ BtRs-BetaCoV/GX2013 (no rank) im National Center for Biotechnology Information (NCBI)
39. ↑ BtRs-BetaCoV/HuB2013 (no rank) im National Center for Biotechnology Information (NCBI)
40. ↑ Bat SARS CoV Rm1/2004 (no rank) im National Center for Biotechnology Information (NCBI)
41. ↑ NCBI: Bat SARS-like coronavirus isolate Rs4231, … (GenBank: KY417146.1).
42. ↑ NCBI: Bat SARS-like coronavirus isolate Rs4247, … (GenBank: KY417148.1).
43. ↑ NCBI: Bat SARS-like coronavirus isolate Rs7327, … (GenBank: KY417151.1).
44. ↑ NCBI: Bat SARS-like coronavirus isolate Rs9401, … (GenBank: KY417152.1).
45. ↑ NCBI: Bat SARS-like coronavirus isolate As6526, … (Genbank: KY417142.1)
46. ↑ NCBI: Severe acute respiratory syndrome-related coronavirus strain BtKY72, … (Genbank: KY352407.1).
47. ↑ NCBI: Bat SARS-like coronavirus isolate bat-SL-CoVZC45, … (Genbank: MG772933.1).
48. ↑ Bat coronavirus BM48-31/BGR/2008 (species) im National Center for Biotechnology Information (NCBI)
49. ↑ Coronavirus BtRs-BetaCoV/YN2018B (species) im National Center for Biotechnology Information (NCBI)
50. ↑ Coronavirus BtRs-BetaCoV/YN2018C (species) im National Center for Biotechnology Information (NCBI)
51. ↑ NCBI Taxonomy Browser: Pangolin coronavirus (species).
52. ↑ Samantha Black: Scientists use bioinformatics to investigate origin of SARS-CoV-2. (PDF) In: The Science Advisory Board. 27. März 2020, abgerufen am 6. Juni 2020 (englisch, Halb kursiv gesetzt: Manis-CoV, scheinbar bzgl. Wirtstier-Typografie: Manis javanica): „[…] the researchers drafted a genome for Manis-CoV that was used in comparison to SARS-CoV-2 using metagenomic samples.“ 
53. ↑ Xiaojun Li, Elena E. Giorgi, Manukumar Honnayakanahalli Marichannegowda, Brian Foley, Chuan Xiao, Xiang-Peng Kong, Yue Chen, S. Gnanakaran, Bette Korber, Feng Gao: Emergence of SARS-CoV-2 through recombination and strong purifying selection. In: Science Advances – AAAs. Artikel-Nr. abb9153. American Association for the Advancement of Science, 29. Mai 2020, ISSN 2375-2548, doi:10.1126/sciadv.abb9153 (englisch, Volltext [PDF; 3,1 MB; abgerufen am 7. Juni 2020]): “These pangolin SARS-like CoVs (Pan_SL-CoV) form two distinct clades corresponding to their locations of origin: the first clade, Pan_SL-CoV_GD, sampled from Guangdong (GD) province in China, […] the second clade, Pan_SL-CoV_GX, sampled from Guangxi (GX) province […].” 
54. ↑ ^{a b c} Hong Zhou, Xing Chen, Tao Hu, Juan Li, Hao Song, Yanran Liu, Peihan Wang, Di Liu, Jing Yang, Edward C.Holmes, Alice C.Hughes, Yuhai Bi, Weifeng Shi: A novel bat coronavirus closely related to SARS-CoV-2 contains natural insertions at the S1/S2 cleavage site of the spike protein. In: Current Biology, Band 30, Nr. 11, 8. Juni 2020; doi:10.1016/j.cub.2020.05.023 (englisch). Dazu:
    • Jacinta Bowler: Researchers Find Another Virus in Bats That's Closely Related to SARS-CoV-2. Auf: science^alert Vom 12. Mai 2020.
55. ↑ NCBI: txid2509511[Organism:exp] AND MP789.
56. ↑ Versuche an Mäusen: China experimentiert mit tödlicher Corona-Variante. Auf: n-tv.de vom 23. Januar 2024.
57. ↑ NCBI SRA: Virome of dead pangolin individuals: SRR10168376.
58. ↑ NCBI SRA: Virome of dead pangolin individuals: SRR10168377.
59. ↑ ^{a b} Xingguang Li, Junjie Zai, Qiang Zhao, Qing Nie, Yi Li, Brian T. Foley, Antoine Chaillon: Evolutionary history, potential intermediate animal host, and cross‐species analyses of SARS‐CoV‐2. In: Journal of Medical Virology, Band 27, Februar 2020; doi:10.1002/jmv.25731, PMID 32104911, ResearchGate:339539236, PDF (englisch).
60. ↑ NCBI SRA: Virome of dead pangolin individuals: SRR10168378.
61. ↑ Pangolin coronavirus GZ5-2 (species) im National Center for Biotechnology Information (NCBI)
62. ↑ Sarbecovirus RhGB01 (species) im National Center for Biotechnology Information (NCBI)
63. ↑ Jack M. Crook, Ivana Murphy, Daniel P. Carter, Steven T. Pullan, Miles Carroll, Richard Vipond, Andrew A. Cunningham, Diana Bell: Metagenomic identification of a new sarbecovirus from horseshoe bats in Europe. In: Scientific Reports, Band 11, Nr. 14723, 19. Juli 2021; doi:10.1038/s41598-021-94011-z (englisch). Dazu:
    • Nadja Podbregar: Neues Coronavirus in britischen Fledermäusen entdeckt. Auf: scinexx.de vom 21. Juli 2021.
    • Tiere aus England und Wales: Neues Coronavirus in Fledermäusen entdeckt. Auf: n-tv.de vom 22. Juli 2021.
64. ↑ SARS-like coronavirus WIV16 (species) im National Center for Biotechnology Information (NCBI)
65. ↑ Bat coronavirus BetaCoV/Rm/Yunnan/YN02/2019 (species) im National Center for Biotechnology Information (NCBI)
66. ↑ NCBI: Coronavirus BtRl-BetaCoV/SC2018, … (Genbank: GenBank: MK211374.1).
67. ↑ Hufeisennasenfledermäuse. (Memento vom 26. September 2020 im Internet Archive) Im Original publiziert von der Schutzgemeinschaft Deutscher Wald, Oberursel, 16. Dezember 2015.
68. ↑ Smriti Mallapaty: Coronaviren in Japan und Kambodscha eng verwandt mit Pandemievirus, auf: Spektrum.de vom 6. Dezember 2020.