Белок промиелоцитарного лейкоза

Белок промиелоцитарного лейкоза
Доступные структуры PDB Поиск ортологов: PDBe RCSB Список идентификаторов PDB 1BOR, 2MVW, 2MWX, 4WJN, 4WJO
Идентификаторы
Псевдонимы	PML, MYL, PP8675, RNF71, TRIM19, Promyelocytic leukemia protein, promyelocytic leukemia, Probable transcription factor PML nuclear body scaffold
Внешние ID	OMIM: 102578 MGI: 104662 HomoloGene: 13245 GeneCards: PML
Расположение гена (человек) Хр. 15-я хромосома человека[1] Локус 15q24.1 Начало 73,994,673 bp[1] Конец 74,047,827 bp[1]
Расположение гена (Мышь) Хр. 9-я хромосома мыши[2] Локус 9 B|9 31.63 cM Начало 58,125,359 bp[2] Конец 58,157,069 bp[2]
Паттерн экспрессии РНК Bgee Человек Мышь (ортолог) Наибольшая экспрессия в body of uterus upper lobe of left lung ectocervix subcutaneous adipose tissue right uterine tube apex of heart right lobe of thyroid gland left lobe of thyroid gland Наибольшая экспрессия в tail of embryo fetal liver hematopoietic progenitor cell tibiofemoral joint Дополнительные справочные данные BioGPS н/д
Генная онтология Молекулярная функция SUMO binding cobalt ion binding связывание с ионом металла гомодимеризация белка zinc ion binding связывание с белками плазмы SMAD binding ДНК-связывающий transcription coactivator activity protein heterodimerization activity ubiquitin protein ligase binding SUMO transferase activity Компонент клетки цитоплазма цитозоль эндосома ядерная мембрана мембрана клеточное ядро Ядерный скелет ядрышко эндоплазматический ретикулум early endosome membrane внутренний компонент клетки нуклеоплазма PML body endoplasmic reticulum membrane extrinsic component of endoplasmic reticulum membrane Гетерохроматин Биологический процесс regulation of protein phosphorylation positive regulation of histone deacetylation intrinsic apoptotic signaling pathway in response to oxidative stress myeloid cell differentiation DNA damage response, signal transduction by p53 class mediator resulting in cell cycle arrest negative regulation of telomere maintenance via telomerase ритмический процесс interferon-gamma-mediated signaling pathway negative regulation of telomerase activity positive regulation of telomere maintenance клеточное старение regulation of cell adhesion defense response to virus intrinsic apoptotic signaling pathway in response to DNA damage positive regulation of extrinsic apoptotic signaling pathway activation of cysteine-type endopeptidase activity involved in apoptotic process transforming growth factor beta receptor signaling pathway proteasome-mediated ubiquitin-dependent protein catabolic process негативная регуляция пролиферации клеток positive regulation of defense response to virus by host апоптоз response to cytokine cell fate commitment negative regulation of translation in response to oxidative stress ДНК-зависимая регуляция транскрипции common-partner SMAD protein phosphorylation branching involved in mammary gland duct morphogenesis extrinsic apoptotic signaling pathway positive regulation of fibroblast proliferation positive regulation of apoptotic signaling pathway endoplasmic reticulum calcium ion homeostasis транскрипция, ДНК-зависимая PML body organization negative regulation of cell growth intrinsic apoptotic signaling pathway by p53 class mediator врождённый иммунитет вирусный процесс response to gamma radiation response to UV regulation of calcium ion transport into cytosol positive regulation of protein localization to chromosome, telomeric region fibroblast migration Внутриклеточная сортировка белков immune system process protein stabilization positive regulation of apoptotic process involved in mammary gland involution circadian regulation of gene expression regulation of MHC class I biosynthetic process regulation of circadian rhythm negative regulation of transcription, DNA-templated maintenance of protein location in nucleus cellular response to interleukin-4 intrinsic apoptotic signaling pathway in response to DNA damage by p53 class mediator response to hypoxia regulation of double-strand break repair intrinsic apoptotic signaling pathway in response to endoplasmic reticulum stress retinoic acid receptor signaling pathway negative regulation of angiogenesis negative regulation of ubiquitin-dependent protein catabolic process entrainment of circadian clock by photoperiod negative regulation of mitotic cell cycle positive regulation of MHC class I biosynthetic process положительная регуляция транскрипции РНК полимеразой II промотор regulation of signal transduction by p53 class mediator cellular response to leukemia inhibitory factor protein import into nucleus protein-containing complex assembly positive regulation of nucleic acid-templated transcription protein sumoylation Источники: Amigo, QuickGO
Ортологи Вид Человек Мышь Entrez 5371 18854 Ensembl ENSG00000140464 ENSMUSG00000036986 UniProt P29590 Q60953 RefSeq (мРНК) NM_033250 NM_002675 NM_033238 NM_033239 NM_033240 NM_033244 NM_033246 NM_033247 NM_033249 NM_008884 NM_178087 NM_001311088 RefSeq (белок) NP_002666 NP_150241 NP_150242 NP_150243 NP_150247 NP_150249 NP_150250 NP_150252 NP_150253 NP_001298017 NP_032910 NP_835188 Локус (UCSC) Chr 15: 73.99 – 74.05 Mb Chr 9: 58.13 – 58.16 Mb Поиск по PubMed Искать[3] Искать[4]
Информация в Викиданных
Смотреть (человек) Смотреть (мышь)

Возможный фактор транскрипции PML является супрессором опухоли белка, кодируемый у человека, геном PML .

Белок, кодируемый этим геном, член семьи трехстороннего мотива (TRIM). Мотив TRIM включает в себя три цинко-связывающих домена, RING, B-бокс типа 1, B-бокс типа 2 и суперспирализованную область. Этот фосфопротеин локализуется в ядерных тельцах, где он функционирует как фактор транскрипции и супрессор опухолевого роста. Его экспрессия приводит к связыванию клеточного цикла и регуляции реакции P53 на онкогенные сигналы. Ген часто бывает вовлечен в транслокацию с рецептором ретиноевой кислоты альфа, геном, связанным с острым промиелоцитарным лейкозом (APL). Обширный альтернативный сплайсинг этого гена приводит к нескольким вариациям в центральной и С-концевых областях белка; все варианты кодируют одно и то же N-окончание. Были идентифицированы альтернативные варианты транскриптов сплайсинга, кодирующие различные изоформы.^[5]

Белок промиелоцитарного лейкоза, как было выявлено, взаимодействует с:

• ANKRD2,^[6]
• CREBBP,^[7][8][9]
• Циклин Т1,^[10]
• DAXX,^{[11][12][13][14]}
• GATA2,^[15]
• HDAC1,^[16][17]
• HDAC3,^[17]
• HHEX,^[18]
• MAPK11,^[19]
• MYB,^[20]
• Mdm2,^{[21][22][23][24]}
• NR4A1,^[25]
• Корепрессор ядерных рецепторов 1,^[16]
• Корепрессор ядерных рецепторов 2,^[16][26]
• P53,^[21][27][28]
• RPL11,^[22]
• Белок ретинобластомы,^[29]
• NR1B1,^[7]
• SIN3A,^[16]
• Белок SKI,^[16]
• STAT3,^[30]
• SRF^[8] и
• SUMO1,^[31][32]
• Sp1,^[33]
• TOPBP1,^[34]
• TDG,^[35] и
• ZBTB16.^[36]