Гистондеацетилаза 8

Гистондеацетилаза 8
Доступные структуры
PDBПоиск ортологов: PDBe RCSB
Список идентификаторов PDB

1T64, 1T67, 1T69, 1VKG, 1W22, 2V5W, 2V5X, 3EW8, 3EWF, 3EZP, 3EZT, 3F06, 3F07, 3F0R, 3MZ3, 3MZ4, 3MZ6, 3MZ7, 3RQD, 3SFF, 3SFH, 4QA0, 4QA1, 4QA2, 4QA3, 4QA4, 4QA5, 4QA6, 4QA7, 4RN0, 4RN1, 4RN2, 5DC7, 5D1D, 5D1C, 5DC8, 5D1B, 5DC5, 5DC6, 5BWZ

Идентификаторы
ПсевдонимыHDAC8, CDLS5, HD8, HDACL1, MRXS6, RPD3, WTS, CDA07, histone deacetylase 8, KDAC8
Внешние IDOMIM: 300269 MGI: 1917565 HomoloGene: 41274 GeneCards: HDAC8
Расположение гена (человек)
X-хромосома человека
Хр.X-хромосома человека[1]
X-хромосома человека
Расположение в геноме HDAC8
Расположение в геноме HDAC8
ЛокусXq13.1Начало72,329,516 bp[1]
Конец72,573,101 bp[1]
Расположение гена (Мышь)
X-хромосома мыши
Хр.X-хромосома мыши[2]
X-хромосома мыши
Расположение в геноме HDAC8
Расположение в геноме HDAC8
ЛокусX|X DНачало101,328,245 bp[2]
Конец101,548,965 bp[2]
Паттерн экспрессии РНК
Bgee
ЧеловекМышь (ортолог)
Наибольшая экспрессия в
Наибольшая экспрессия в
Дополнительные справочные данные
BioGPS
н/д
Генная онтология
Молекулярная функция
Компонент клетки
Биологический процесс
Источники: Amigo, QuickGO
Ортологи
ВидЧеловекМышь
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (мРНК)
NM_001166418
NM_001166419
NM_001166420
NM_001166422
NM_001166448

NM_018486

NM_027382
NM_001313742

RefSeq (белок)
NP_001159890
NP_001159891
NP_001159892
NP_001159894
NP_001159920

NP_060956

NP_001300671
NP_081658

Локус (UCSC)Chr X: 72.33 – 72.57 MbChr X: 101.33 – 101.55 Mb
Поиск по PubMedИскать[3]Искать[4]
Логотип Викиданных Информация в Викиданных
Смотреть (человек)Смотреть (мышь)

Гистондеацетилаза 8 (англ. Histone deacetylase 8) — фермент, кодируемый у человека геном HDAC8 [5][6][7].

Гистоны играют важнейшую роль в регуляции транскрипции, прогрессировании клеточного цикла и процессов развития. Ацетилирование/деацетилирование гистонов изменяет хромосомную структуру и влияет на доступ факторов транскрипции к ДНК. Белок, кодируемый этим геном относится к классу I в семействе гистондезацетилазы/acuc/Apha. Он обладает деятельностью гистондеацетилазы и подавляет транскрипцию, когда связан с промотором[7].

Гистондеацетилаза 8 участвует в морфогенезе черепа[8] и метаболическом контроле над комплексом транскрипции ERR-альфа[англ.]/PGC1-alpha[англ.][9].

Клиническое значение

[править | править код]

HDAC8 был связан с некоторым числом болезненных состояний, в частности, с острым миелоидным лейкозом, а также связан с актиновым цитоскелетом в клетках гладких мышц. миРНК ориентированные на HDAC8 показали противораковые эффекты[10]. Ингибирование индуцированного апоптоза посредством HDAC8 наблюдается при Т-клеточных лимфомах[англ.][11]. Кроме того фермент HDAC8 участвует в патогенезе нейробластомы[12]. Таким образом, существует интерес к разработке селективных ингибиторов на базе HDAC8[13][14].

Взаимодействия

[править | править код]

Примечания

[править | править код]
  1. 1 2 3 GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000147099 - Ensembl, May 2017
  2. 1 2 3 GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000067567 - Ensembl, May 2017
  3. Ссылка на публикацию человека на PubMed: Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  4. Ссылка на публикацию мыши на PubMed: Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  5. McDonell N., Ramser J., Francis F., Vinet M.C., Rider S., Sudbrak R., Riesselman L., Yaspo M.L., Reinhardt R., Monaco A.P., Ross F., Kahn A., Kearney L., Buckle V., Chelly J. Characterization of a highly complex region in Xq13 and mapping of three isodicentric breakpoints associated with preleukemia (англ.) // Genomics : journal. — Academic Press, 2000. — May (vol. 64, no. 3). — P. 221—229. — doi:10.1006/geno.2000.6128. — PMID 10756090.
  6. Van den Wyngaert I., de Vries W., Kremer A., Neefs J., Verhasselt P., Luyten W.H., Kass S.U. Cloning and characterization of human histone deacetylase 8 (англ.) // FEBS Lett[англ.] : journal. — 2000. — August (vol. 478, no. 1—2). — P. 77—83. — doi:10.1016/S0014-5793(00)01813-5. — PMID 10922473.
  7. 1 2 Entrez Gene: HDAC8 histone deacetylase 8.
  8. Haberland M., Mokalled M.H., Montgomery R.L., Olson E.N. Epigenetic control of skull morphogenesis by histone deacetylase 8 (англ.) // Genes Dev. : journal. — 2009. — July (vol. 23, no. 14). — P. 1625—1630. — doi:10.1101/gad.1809209. — PMID 19605684. — PMC 2714711.
  9. 1 2 Wilson B.J., Tremblay A.M., Deblois G., Sylvain-Drolet G., Giguère V. An acetylation switch modulates the transcriptional activity of estrogen-related receptor alpha (англ.) // Mol. Endocrinol.[англ.] : journal. — 2010. — July (vol. 24, no. 7). — P. 1349—1358. — doi:10.1210/me.2009-0441. — PMID 20484414.
  10. Gallinari P., Di Marco S., Jones P., Pallaoro M., Steinkühler C. HDACs, histone deacetylation and gene transcription: from molecular biology to cancer therapeutics (англ.) // Cell Res.[англ.] : journal. — 2007. — March (vol. 17, no. 3). — P. 195—211. — doi:10.1038/sj.cr.7310149. — PMID 17325692.
  11. Balasubramanian S., Ramos J., Luo W., Sirisawad M., Verner E., Buggy J.J. A novel histone deacetylase 8 (HDAC8)-specific inhibitor PCI-34051 induces apoptosis in T-cell lymphomas (англ.) // Leukemia : journal. — 2008. — May (vol. 22, no. 5). — P. 1026—1034. — doi:10.1038/leu.2008.9. — PMID 18256683.
  12. Oehme I., Deubzer H.E., Wegener D., Pickert D., Linke J.P., Hero B., Kopp-Schneider A., Westermann F., Ulrich S.M., von Deimling A., Fischer M., Witt O. Histone deacetylase 8 in neuroblastoma tumorigenesis (англ.) // Clin. Cancer Res.[англ.] : journal. — 2009. — January (vol. 15, no. 1). — P. 91—9. — doi:10.1158/1078-0432.CCR-08-0684. — PMID 19118036.
  13. Patil V., Sodji Q.H., Kornacki J.R., Mrksich M., Oyelere A.K. 3-Hydroxypyridin-2-thione as novel zinc binding group for selective histone deacetylase inhibition (англ.) // Journal of Medicinal Chemistry[англ.] : journal. — 2013. — May (vol. 56, no. 9). — P. 3492—3506. — doi:10.1021/jm301769u. — PMID 23547652.
  14. Suzuki T., Ota Y., Ri M., Bando M., Gotoh A., Itoh Y., Tsumoto H., Tatum P.R., Mizukami T., Nakagawa H., Iida S., Ueda R., Shirahige K., Miyata N. Rapid discovery of highly potent and selective inhibitors of histone deacetylase 8 using click chemistry to generate candidate libraries (англ.) // Journal of Medicinal Chemistry[англ.] : journal. — 2012. — November (vol. 55, no. 22). — P. 9562—9575. — doi:10.1021/jm300837y. — PMID 23116147.

Литература

[править | править код]