KRAS

KRAS
Доступные структуры
PDBПоиск ортологов: PDBe RCSB
Список идентификаторов PDB

4WA7, 1D8D, 1D8E, 3GFT, 4DSN, 4DSO, 4EPR, 4EPT, 4EPV, 4EPW, 4EPX, 4EPY, 4L8G, 4LDJ, 4LPK, 4LRW, 4LUC, 4LV6, 4LYF, 4LYH, 4LYJ, 4M1O, 4M1S, 4M1T, 4M1W, 4M1Y, 4M21, 4M22, 4NMM, 4OBE, 4PZY, 4PZZ, 4Q01, 4Q02, 4Q03, 4QL3, 4TQ9, 4TQA, 4DST, 4DSU, 5F2E,%%s2MSC, 2MSD, 2MSE

Идентификаторы
ПсевдонимыKRAS, C-K-RAS, CFC2, K-RAS2A, K-RAS2B, K-RAS4A, K-RAS4B, KI-RAS, KRAS1, KRAS2, NS, NS3, RALD, RASK2, K-ras, KRAS proto-oncogene, GTPase, c-Ki-ras2, OES, c-Ki-ras, K-Ras 2, 'C-K-RAS, K-Ras, Kirsten RAt Sarcoma virus, Kirsten Rat Sarcoma virus
Внешние IDOMIM: 190070 MGI: 96680 HomoloGene: 37990 GeneCards: KRAS
Расположение гена (человек)
12-я хромосома человека
Хр.12-я хромосома человека[1]
12-я хромосома человека
Расположение в геноме KRAS
Расположение в геноме KRAS
Локус12p12.1Начало25,205,246 bp[1]
Конец25,250,936 bp[1]
Расположение гена (Мышь)
6-я хромосома мыши
Хр.6-я хромосома мыши[2]
6-я хромосома мыши
Расположение в геноме KRAS
Расположение в геноме KRAS
Локус6 G3|6 77.37 cMНачало145,162,425 bp[2]
Конец145,195,965 bp[2]
Паттерн экспрессии РНК
Bgee
ЧеловекМышь (ортолог)
Наибольшая экспрессия в
Наибольшая экспрессия в
Дополнительные справочные данные
BioGPS




Дополнительные справочные данные
Генная онтология
Молекулярная функция
Компонент клетки
Биологический процесс
Источники: Amigo, QuickGO
Ортологи
ВидЧеловекМышь
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (мРНК)

NM_004985
NM_033360
NM_001369786
NM_001369787

NM_021284

RefSeq (белок)

NP_004976
NP_203524
NP_001356715
NP_001356716
NP_004976.2

NP_067259
NP_001390169
NP_001390170
NP_001390171
NP_001390172

NP_001390173
NP_001390174
NP_001390175

Локус (UCSC)Chr 12: 25.21 – 25.25 MbChr 6: 145.16 – 145.2 Mb
Поиск по PubMedИскать[3]Искать[4]
Логотип Викиданных Информация в Викиданных
Смотреть (человек)Смотреть (мышь)

KRAS — протоонкоген, представитель семейства белков Ras. Белок KRAS представляет собой ГТФазу и является компонентом многих путей передачи сигнала. KRAS имеет изопрениловую группу на С-конце и обычно связан с клеточными мембранами.

KRAS действует как «молекулярный переключатель», после включения он активирует белки, необходимые для распространения факторов роста и других путей, таких, как c-Raf и PI 3-kinase. KRAS связывает GTP в активном состоянии и может превращать его в GDP. После превращения GTP в GDP, белок KRAS «выключается». Скорость превращения обычно низкая, но может значительно повышаться при действии вспомогательных белков, усиливающих ГТФазную активность, например, RasGAP. KRAS в свою очередь может связываться с белками GEF, например, SOS1, которые облегчают освобождение связанных нуклеотидов. Соответственно, KRAS без нуклеотида легко связывает новые молекулы GTP или GDP из цитозоля. Ввиду того, что концентрация GTP в цитозоле значительно выше, чем GDP, это обычно приводит к активации KRAS.

Другие представители семейства белков Ras: HRAS, RRAS и NRAS. Эти белки подвергаются регуляции подобным образом, но работают в разных местах клетки.

Заболевания

[править | править код]

Некоторые мутации KRAS в клетках зародышевого пути связаны с синдромом Нунан[5] и синдромом сердце-лицо-кожа (en:cardio-facio-cutaneous syndrome).[6]

Соматические мутации гена KRAS часто обнаруживают при лейкемиях, раке толстой кишки,[7] раке поджелудочной железы[8] и раке легких.[9] Определение мутационного статуса гена KRAS имеет значение при планировании терапии препаратами блокаторами EGFR, такими как цетуксимаб, в случае рака толстой кишки.[10] Мутация в гене KRAS обуславливает лиганд-независимую активацию пути передачи сигнала Ras/MAPK. Таким образом, карциномы с мутантным KRAS резистентны [11] к терапии анти-EGFR моноклональными антителами (панитумумаб, цетуксимаб, где «маб» — означает моноклональное антитело) и ингибиторами EGFR-TK (en:erlotinib, en:gefitinib).

Исследование KRAS

[править | править код]

Анализ мутаций KRAS делают некоторые лаборатории на коммерческой основе.

Примечания

[править | править код]
  1. 1 2 3 GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000133703 - Ensembl, May 2017
  2. 1 2 3 GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000030265 - Ensembl, May 2017
  3. Ссылка на публикацию человека на PubMed: Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  4. Ссылка на публикацию мыши на PubMed: Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  5. Schubbert S., Zenker M., Rowe S. L., et al. Germline KRAS mutations cause Noonan syndrome (англ.) // Nat. Genet. : journal. — 2006. — Vol. 38, no. 3. — P. 331—336. — doi:10.1038/ng1748. — PMID 16474405.
  6. Niihori T., Aoki Y., Narumi Y., et al. Germline KRAS and BRAF mutations in cardio-facio-cutaneous syndrome (англ.) // Nat. Genet. : journal. — 2006. — Vol. 38, no. 3. — P. 294—296. — doi:10.1038/ng1749. — PMID 16474404.
  7. Burmer G. C., Loeb L. A. Mutations in the KRAS2 oncogene during progressive stages of human colon carcinoma (англ.) // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : journal. — 1989. — Vol. 86, no. 7. — P. 2403—2407. — doi:10.1073/pnas.86.7.2403. — PMID 2648401.
  8. Almoguera C., Shibata D., Forrester K., Martin J., Arnheim N., Perucho M. Most human carcinomas of the exocrine pancreas contain mutant c-K-ras genes (англ.) // Cell : journal. — Cell Press, 1988. — Vol. 53, no. 4. — P. 549—554. — doi:10.1016/0092-8674(88)90571-5. — PMID 2453289.
  9. Tam I. Y., Chung L. P., Suen W. S., et al. Distinct epidermal growth factor receptor and KRAS mutation patterns in non-small cell lung cancer patients with different tobacco exposure and clinicopathologic features (англ.) // Clin. Cancer Res.[англ.] : journal. — 2006. — Vol. 12, no. 5. — P. 1647—1653. — doi:10.1158/1078-0432.CCR-05-1981. — PMID 16533793.
  10. Lièvre A., Bachet J. B., Le Corre D., et al. KRAS mutation status is predictive of response to cetuximab therapy in colorectal cancer (англ.) // Cancer Research[англ.] : journal. — American Association for Cancer Research[англ.], 2006. — Vol. 66, no. 8. — P. 3992—3995. — doi:10.1158/0008-5472.CAN-06-0191. — PMID 16618717.
  11. EGF receptor. Дата обращения: 5 ноября 2007. Архивировано 25 марта 2012 года.

Литература

[править | править код]
  • Kahn S., Yamamoto F., Almoguera C., et al. The c-K-ras gene and human cancer (review). (англ.) // Anticancer Res.[англ.] : journal. — 1987. — Vol. 7, no. 4A. — P. 639—652. — PMID 3310850.
  • Yamamoto F., Nakano H., Neville C., Perucho M. Structure and mechanisms of activation of c-K-ras oncogenes in human lung cancer. (англ.) // Prog. Med. Virol. : journal. — 1985. — Vol. 32. — P. 101—114. — PMID 3895297.
  • Porta M., Ayude D., Alguacil J., Jariod M. Exploring environmental causes of altered ras effects: fragmentation plus integration? (англ.) // Mol. Carcinog. : journal. — 2003. — Vol. 36, no. 2. — P. 45—52. — doi:10.1002/mc.10093. — PMID 12557259.
  • Smakman N., Borel Rinkes I. H., Voest E. E., Kranenburg O. Control of colorectal metastasis formation by K-Ras. (англ.) // Biochim. Biophys. Acta[англ.] : journal. — 2006. — Vol. 1756, no. 2. — P. 103—114. — doi:10.1016/j.bbcan.2005.07.001. — PMID 16098678.
  • Castagnola P., Giaretti W. Mutant KRAS, chromosomal instability and prognosis in colorectal cancer. (англ.) // Biochim. Biophys. Acta[англ.] : journal. — 2006. — Vol. 1756, no. 2. — P. 115—125. — doi:10.1016/j.bbcan.2005.06.003. — PMID 16112461.
  • Deramaudt T., Rustgi A. K. Mutant KRAS in the initiation of pancreatic cancer. (англ.) // Biochim. Biophys. Acta[англ.] : journal. — 2006. — Vol. 1756, no. 2. — P. 97—101. — doi:10.1016/j.bbcan.2005.08.003. — PMID 16169155.
  • Pretlow T. P., Pretlow T. G. Mutant KRAS in aberrant crypt foci (ACF): initiation of colorectal cancer? (англ.) // Biochim. Biophys. Acta[англ.] : journal. — 2006. — Vol. 1756, no. 2. — P. 83—96. — doi:10.1016/j.bbcan.2005.06.002. — PMID 16219426.
  • Su Y. H., Wang M., Aiamkitsumrit B., et al. Detection of a K-ras mutation in urine of patients with colorectal cancer. (англ.) // Cancer biomarkers : section a of Disease markers : journal. — 2007. — Vol. 1, no. 2—3. — P. 177—182. — PMID 17192038.