FAM162A

FAM162A
Identifikatori
AliasiFAM162A
Vanjski ID-jeviOMIM: 608017 MGI: 1917436 HomoloGene: 8656 GeneCards: FAM162A
Lokacija gena (čovjek)
Hromosom 3 (čovjek)
Hrom.Hromosom 3 (čovjek)[1]
Hromosom 3 (čovjek)
Genomska lokacija za FAM162A
Genomska lokacija za FAM162A
Bend3q21.1Početak122,384,161 bp[1]
Kraj122,412,334 bp[1]
Lokacija gena (miš)
Hromosom 16 (miš)
Hrom.Hromosom 16 (miš)[2]
Hromosom 16 (miš)
Genomska lokacija za FAM162A
Genomska lokacija za FAM162A
Bend16|16 B3Početak35,864,131 bp[2]
Kraj35,891,964 bp[2]
Ontologija gena
Molekularna funkcija GO:0001948, GO:0016582 vezivanje za proteine
Ćelijska komponenta integral component of membrane
membrana
mitohondrija
citosol
Biološki proces GO:0097285 apoptoza
neuron apoptotic process
positive regulation of release of cytochrome c from mitochondria
activation of cysteine-type endopeptidase activity involved in apoptotic process
cellular response to hypoxia
positive regulation of apoptotic process
Izvori:Amigo / QuickGO
Ortolozi
VrsteČovjekMiš
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (mRNK)

NM_014367

NM_027342

RefSeq (bjelančevina)

NP_055182

NP_081618

Lokacija (UCSC)Chr 3: 122.38 – 122.41 MbChr 16: 35.86 – 35.89 Mb
PubMed pretraga[3][4]
Wikipodaci
Pogledaj/uredi – čovjekPogledaj/uredi – miš

Ovisni protein o ljudskom rastu i transformaciji (HGTD-P), znan i kao protein E2-induciranog gena 5 (E2IG5), jest protein koji je kod ljudi kodiran genom FAM162A sa hromosoma 3.[5][6] Ovaj protein podstiče unutrašnju apoptozu, kao odgovor na hipoksiju putem interakcije sa faktorom-1α induciranim hipoksijom (HIF-1α).[5][7][8][9][10][11] Kao posljedica toga, povezan je s cerebralnom ishemijom, infarktom miokarda i raznim kancerima.[8][12][13]

Aminokiselinska sekvenca

[uredi | uredi izvor]

Dužina polipeptidnog lanca je 154 aminokiseline, а molekulska težina 17.342 Da.[14]

1020304050
MGSLSGLRLAAGSCFRLCERDVSSSLRLTRSSDLKRINGFCTKPQESPGA
PSRTYNRVPLHKPTDWQKKILIWSGRFKKEDEIPETVSLEMLDAAKNKMR
VKISYLMIALTVVGCIFMVIEGKKAAQRHETLTSLNLEKKARLKEEAAMK
AKTE

Struktura

[uredi | uredi izvor]

HGTD-P sadrži dva transmembranska domena koji su potrebni za njegovu lokalizaciju u mitohondrije i indukciju ćelijske smrti.[8]

Funkcija

[uredi | uredi izvor]

HGTD-P nalazi se u mitohondrijama, gdje sudjeluje u regulaciji apoptoze.[5][8] Ova lokalizacija potpomognuta je šaperonom Hsp90, koji je neophodan za stabilizaciju proteina tokom tranzita.[7][10] HGTD-P primarno djeluje uodgovoru na hipoksiju interakcijom s HIF-1α, pokrećući apoptotske kaskade koje rezultiraju oslobađanjem citohroma C, indukcijom tranzicije mitohondrijske permeabilnosti i aktivacijom kaspaza-9 i 3.[5][7][8][10][11] U neuronskim ćelijama, dodatno stimulira mitohondrijsko oslobađanje AIFM1, koji se zatim translocira u jedro da bi izvršio apoptozu, što ukazuje da može učestvovati u kaspaza-nezavisnom apoptotskom putu u zavisnosti od tipa ćelije ili organizma.[5][9][10]

Klinički značaj

[uredi | uredi izvor]

Protein ovisan o ljudskom rastu i transformaciji (HGTD-P) uključen je u unutrašnju apoptozu. Apoptoza, drevna grčka riječ koja se koristila da opiše "opadanje" latica s cvijeća ili lišća s drveća, visoko je regulirana, evolucijski konzerviran i energetski zahtijevan proces kojim aktivacija specifičnih signalnih kaskada na kraju dovodi do ćelijske smrti. Apoptotaka ćelija prolazi kroz strukturne promjene, uključujući skupljanje ćelije, mjehuriće plazmamembrane, jedarnu kondenzaciju i fragmentaciju DNK i jedra. Nakon toga slijedi fragmentacija u apoptotska tijela koja se brzo uklanjaju fagociti, čime se sprječava upalni odgovor.[15] To je način ćelijske smrti definiran karakterističnim morfološkim, biohemijskim i molekulskim promjenama. Prvo je opisano kao "skupljanje nekroza", a zatim je ovaj termin zamijenjen apoptozom, kako bi se naglasila njegova uloga suprotna mitozi u kinetici tkiva. Tokom apoptoze, ćelija se smanjuje u veličini, labavi kontakt sa susjednim ćelijamama i specijalizovani površinskim elementima, kao što su mikroresice i spojevi ćelija-ćelija. Pomicanje tekućine iz ćelija uzrokuje kondenzaciju citoplazme, što je praćeno konvolucijom jedarnog i ćelijskog obrisa. U kasnijim fazama apoptoze, cijela ćelija postaje fragmentirana, formirajući niz apoptotskih tijela ograničenih plazmamembranom koja sadrže jedarn i/ili citoplazmatske elemente. Ultrastrukturni izgled nekroze je sasvim drugačiji, a glavne karakteristike su naticanje mitohondrija, slom plazmamembrane i ćelijska dezintegracija. Apoptoza se javlja u mnogim fiziološkim i patološkim procesima. Ima važnu ulogu tokom embrionskog razvoja, kao programirana ćelijska smrt i prati niz normalnih involucionih procesa u kojima služi kao mehanizam za uklanjanje "neželjenih" ćelija.

Zbog svoje uključenosti u hipoksiju, HGTD-P je uključen i u cerebralnu ishemiju i infarkt miokarda, kao i brojne tipovw raka, uključujući rak grlića maternice i rak želuca.[8][12][13] U slučaju raka grlića materice, HGTD-P je eksprimiran u ranim razvojnim fazama i stoga se može pokazati korisnim kao dijagnostički marker za kontrolu širenja raka. Unatoč svojoj proapoptotskoj funkciji, uočeno je da koordinira sa HIF-1α, kako bi promovirao rast i proliferaciju ćelija u hipoksijskim uvjetima kod raka grlića materice.[12] U slučaju oštećenja mozga hipoksije-ishemije, mikroRNK, miR-139-5p, smanjuje ekspresiju HGTD-P i oštećenje mozga, te ima terapeutski potencijal za liječenje hipoksijsko-ishemijskog oštećenja mozga.[11][16]

Interakcije

[uredi | uredi izvor]

Pokazano je da HGTD-P ima interakcije sa Hsp90[7] i VDAC.[8] Poznato je da se HIF-1α također veže za element odgovoran za hipoksiju promotora HGTD-P i i djeluje kao transkripcijski faktor, tj. inducira transkripciju.[9]

Reference

[uredi | uredi izvor]
  1. ^ a b c GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000114023 - Ensembl, maj 2017
  2. ^ a b c GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000003955 - Ensembl, maj 2017
  3. ^ "Human PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  4. ^ "Mouse PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  5. ^ a b c d e "FAM162A - Protein FAM162A - Homo sapiens (Human)". Uniprot.org. 31. 10. 2006. Pristupljeno 30. 5. 2015.
  6. ^ "FAM162A family with sequence similarity 162, member A [Homo sapiens (human)] - Gene - NCBI". Ncbi.nlm.nih.gov. Pristupljeno 30. 5. 2015.
  7. ^ a b c d Kim JY, Kim SM, Ko JH, Yim JH, Park JH, Park JH (maj 2006). "Interaction of pro-apoptotic protein HGTD-P with heat shock protein 90 is required for induction of mitochondrial apoptotic cascades". FEBS Letters. 580 (13): 3270–5. doi:10.1016/j.febslet.2006.05.001. PMID 16698020. S2CID 13992300.
  8. ^ a b c d e f g Lee MJ, Kim JY, Suk K, Park JH (maj 2004). "Identification of the hypoxia-inducible factor 1 alpha-responsive HGTD-P gene as a mediator in the mitochondrial apoptotic pathway". Molecular and Cellular Biology. 24 (9): 3918–27. doi:10.1128/mcb.24.9.3918-3927.2004. PMC 387743. PMID 15082785.
  9. ^ a b c Qu Y, Mao M, Zhao F, Zhang L, Mu D (Aug 2009). "Proapoptotic role of human growth and transformation-dependent protein in the developing rat brain after hypoxia-ischemia". Stroke: A Journal of Cerebral Circulation. 40 (8): 2843–8. doi:10.1161/STROKEAHA.109.553644. PMID 19520982.
  10. ^ a b c d Cho YE, Ko JH, Kim YJ, Yim JH, Kim SM, Park JH (Apr 2007). "mHGTD-P mediates hypoxic neuronal cell death via the release of apoptosis-inducing factor". Neuroscience Letters. 416 (2): 144–9. doi:10.1016/j.neulet.2007.01.073. PMID 17316997. S2CID 33662614.
  11. ^ a b c Webster KA, Graham RM, Thompson JW, Spiga MG, Frazier DP, Wilson A, Bishopric NH (2006). "Redox stress and the contributions of BH3-only proteins to infarction". Antioxidants & Redox Signaling. 8 (9–10): 1667–76. doi:10.1089/ars.2006.8.1667. PMID 16987020.
  12. ^ a b c Cho YE, Kim JY, Kim YJ, Kim YW, Lee S, Park JH (Sep 2010). "Expression and clinicopathological significance of human growth and transformation-dependent protein (HGTD-P) in uterine cervical cancer". Histopathology. 57 (3): 479–82. doi:10.1111/j.1365-2559.2010.03627.x. PMC 3066410. PMID 20840676.
  13. ^ a b Cho YE, Kim JY, Kim YW, Park JH, Lee S (Jul 2009). "Expression and prognostic significance of human growth and transformation-dependent protein in gastric carcinoma and gastric adenoma". Human Pathology. 40 (7): 975–81. doi:10.1016/j.humpath.2008.12.007. PMID 19269009.
  14. ^ "UniProt, Q96A26" (jezik: engleski). Pristupljeno 7. 11. 2017.
  15. ^ Kerr JF, Wyllie AH, Currie AR (Aug 1972). "Apoptosis: a basic biological phenomenon with wide-ranging implications in tissue kinetics". British Journal of Cancer. 26 (4): 239–57. doi:10.1038/bjc.1972.33. PMC 2008650. PMID 4561027.
  16. ^ Qu Y, Wu J, Chen D, Zhao F, Liu J, Yang C, Wei D, Ferriero DM, Mu D (Mar 2014). "MiR-139-5p inhibits HGTD-P and regulates neuronal apoptosis induced by hypoxia-ischemia in neonatal rats". Neurobiology of Disease. 63: 184–93. doi:10.1016/j.nbd.2013.11.023. PMID 24333693. S2CID 26305530.