USP1

USP1
Identifikatori
AliasiUSP1
Vanjski ID-jeviOMIM: 603478 MGI: 2385198 HomoloGene: 2528 GeneCards: USP1
Lokacija gena (čovjek)
Hromosom 1 (čovjek)
Hrom.Hromosom 1 (čovjek)[1]
Hromosom 1 (čovjek)
Genomska lokacija za USP1
Genomska lokacija za USP1
Bend1p31.3Početak62,436,297 bp[1]
Kraj62,451,804 bp[1]
Lokacija gena (miš)
Hromosom 4 (miš)
Hrom.Hromosom 4 (miš)[2]
Hromosom 4 (miš)
Genomska lokacija za USP1
Genomska lokacija za USP1
Bend4|4 C6Početak98,812,047 bp[2]
Kraj98,823,780 bp[2]
Obrazac RNK ekspresije


Više referentnih podataka o ekspresiji
Ontologija gena
Molekularna funkcija cysteine-type peptidase activity
GO:0001948, GO:0016582 vezivanje za proteine
hydrolase activity
thiol-dependent deubiquitinase
cysteine-type endopeptidase activity
GO:0070122 peptidase activity
Ćelijska komponenta jedro
nukleoplazma
Biološki proces skeletal system development
monoubiquitinated protein deubiquitination
response to UV
ubiquitin-dependent protein catabolic process
Proteoliza
cellular response to DNA damage stimulus
protein deubiquitination
GO:0100026 Popravka DNK
regulation of DNA repair
interstrand cross-link repair
Izvori:Amigo / QuickGO
Ortolozi
VrsteČovjekMiš
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (mRNK)

NM_003368
NM_001017415
NM_001017416

NM_001301414
NM_146144
NM_001356424

RefSeq (bjelančevina)

NP_001017415
NP_001017416
NP_003359

NP_001288343
NP_666256
NP_001343353

Lokacija (UCSC)Chr 1: 62.44 – 62.45 MbChr 4: 98.81 – 98.82 Mb
PubMed pretraga[3][4]
Wikipodaci
Pogledaj/uredi – čovjekPogledaj/uredi – miš

Ubikvitin karboksil-terminalna hidrolaza 1 jest enzim koji je kod ljudi kodiran genom USP1 sa hromosoma 1.[5][6]

Aminokiselinska sekvenca

[uredi | uredi izvor]

Dužina polipeptidnog lanca je 785 aminokiselina, a molekulska težina 88.207 Da.[7].

1020304050
MPGVIPSESNGLSRGSPSKKNRLSLKFFQKKETKRALDFTDSQENEEKAS
EYRASEIDQVVPAAQSSPINCEKRENLLPFVGLNNLGNTCYLNSILQVLY
FCPGFKSGVKHLFNIISRKKEALKDEANQKDKGNCKEDSLASYELICSLQ
SLIISVEQLQASFLLNPEKYTDELATQPRRLLNTLRELNPMYEGYLQHDA
QEVLQCILGNIQETCQLLKKEEVKNVAELPTKVEEIPHPKEEMNGINSIE
MDSMRHSEDFKEKLPKGNGKRKSDTEFGNMKKKVKLSKEHQSLEENQRQT
RSKRKATSDTLESPPKIIPKYISENESPRPSQKKSRVKINWLKSATKQPS
ILSKFCSLGKITTNQGVKGQSKENECDPEEDLGKCESDNTTNGCGLESPG
NTVTPVNVNEVKPINKGEEQIGFELVEKLFQGQLVLRTRCLECESLTERR
EDFQDISVPVQEDELSKVEESSEISPEPKTEMKTLRWAISQFASVERIVG
EDKYFCENCHHYTEAERSLLFDKMPEVITIHLKCFAASGLEFDCYGGGLS
KINTPLLTPLKLSLEEWSTKPTNDSYGLFAVVMHSGITISSGHYTASVKV
TDLNSLELDKGNFVVDQMCEIGKPEPLNEEEARGVVENYNDEEVSIRVGG
NTQPSKVLNKKNVEAIGLLGGQKSKADYELYNKASNPDKVASTAFAENRN
SETSDTTGTHESDRNKESSDQTGINISGFENKISYVVQSLKEYEGKWLLF
DDSEVKVTEEKDFLNSLSPSTSPTSTPYLLFYKKL

Funkcija

[uredi | uredi izvor]

Ovaj gen kodira člana porodice ubikvitin-specifične obrade (UBP) proteaza koji je deubikvitinirajući enzim (DUB) sa His i Cys domenima. Ovaj protein nalazi se u citoplazmi i cijepa ubikvitinski dio prekursora spojenih na ubikvitin i ubikvitiniliranih proteina.

Protein specifično deubikvitinira protein u putu popravke DNK Fanconijeve anemije (FA). Karakterizirana je alternativna transkripcija sa varijantama prerade.[6]

Reference

[uredi | uredi izvor]
  1. ^ a b c GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000162607 - Ensembl, maj 2017
  2. ^ a b c GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000028560 - Ensembl, maj 2017
  3. ^ "Human PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  4. ^ "Mouse PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  5. ^ Puente XS, Sanchez LM, Overall CM, Lopez-Otin C (Jul 2003). "Human and mouse proteases: a comparative genomic approach". Nat Rev Genet. 4 (7): 544–58. doi:10.1038/nrg1111. PMID 12838346. S2CID 2856065.
  6. ^ a b "Entrez Gene: USP1 ubiquitin specific peptidase 1".
  7. ^ "UniProt, O94782" (jezik: engleski). Pristupljeno 1. 12. 2021.

Dopunska literatura

[uredi | uredi izvor]

Vanjski linkovi

[uredi | uredi izvor]