С началом войны 15 сентября 1941 года на базе управления и войск Забайкальского военного округа был сформирован Забайкальский фронт. Одновременно с формированием фронта на базе управления ВВС Забайкальского военного округа были сформированы ВВС Забайкальского фронта. Войска ВВС фронта боевых действий не вели, а выполняли задачи по охране и обороне государственных границ СССР[1].
Приказом НКО СССР от 27 июля 1942 года на базе ВВС Забайкальского фронта 15 августа 1942 года сформирована 12-я воздушная армия в составе: управления, 30-й и 247-й бомбардировочных, 245-й и 246-й истребительных, 248-й штурмовой дивизий и других формирований. Армия перешла в оперативное подчинение Забайкальского фронта.