Гем а
гем а | |
---|---|
| |
Общие | |
Традиционные названия | Железо-цитопорфирин IX, формилпорфирин |
Хим. формула | C49H56O6N4Fe |
Рац. формула | C49H56O6N4Fe |
Физические свойства | |
Молярная масса | 852.837 г/моль |
Классификация | |
Рег. номер CAS | 18535-39-2 |
PubChem | 5288529 |
SMILES | |
InChI | |
ChEBI | 24479 |
ChemSpider | 21106444 |
Безопасность | |
NFPA 704 | |
Приведены данные для стандартных условий (25 °C, 100 кПа), если не указано иное. | |
Медиафайлы на Викискладе |
Гем а — вид гема, координационный комплекс макроциклического лиганда порфирина и атома железа.
Связь с другими гемами
[править | править код]Гем а отличается от гема В тем, что его боковая метильная цепь в восьмой позиции окислена до альдегидной группы, а гидроксиметилфарнезильная группа присоединена к боковой винильной цепи в позиции три. Гем а похож по строению на гем О: оба содержат фарнезеновый радикал в позиции три, но у гем а О нет альдегидной группы, вместо неё он сохраняет метильную. Точная структура гема а, основанная на исследовании восстановленного гема с Fe(II) методом ядерного магнитного резонанса и инфракрасной спектроскопии, была опубликована в 1975 году[1].
История
[править | править код]Гем а был впервые изолирован немецким биохимиком Отто Варбургом в 1951 году. Им же было доказано, что он является активным компонентом встроенного в мембрану металлопротеина цитохром c-оксидазы[2].
Стереохимия
[править | править код]До последнего времени вопрос о полной химической структуре гема а был не разрешён, до конца оставалось неясным геометрическое положения атома углерода в 3-й позиции кольца I. Недавно было опубликовано исследование, установившее его принадлежность к хиральной S-конфигурации[3].
Как и гем b, гем а обычно связан с аппопротеином через координационные связи между гемом железа и боковыми цепочками аминокислот. Он содержится в гемоглобине, миоглобине, а также в важном ферменте дыхательной цепи — цитохром с-оксидазе[4].
Гем а в цитохром-оксидазе с(ЦСО) крепится двумя боковыми гистидиновыми цепочками (показаны розовым)[5]
Примером металлопротеина, содержащего гем а, является цитохром с-оксидаза. Этот очень сложный белок содержит гем а на двух сайтах, выполняющих различные функции. Железо гема а в цитохроме а шестикоординированно, поскольку связано с шестью другими атомами, а в цитохроме а3 оно соединено только с пятью атомами, что делает шестую связь доступной для связывания с молекулярным кислородом[5]. Кроме того, фермент несёт на себе три иона меди и несколько ионов калия и натрия. Полагают, что оба гема А в ЦСО с лёгкостью обмениваются электронами между собой, а также с ионами меди и близко расположенным цитохромом с.
Согласно современным представлением две формильные группы и изопреноидная боковая цепь играют важную роль в сохранении энергии восстановления кислорода цитохром с-оксидазой. ЦСО, по-видимому, ответственна за сохранение этой энергии и перекачку протонов во внутримитохондриальное пространство[6].
См. также
[править | править код]- Гемопротеин
- Цитохром с-оксидаза (IV комплекс цепи клеточного дыхания)
Источники
[править | править код]- ↑ Caughey, W.S. et al. Heme A of Cytochrome c Oxidase (англ.) // Journal of Biological Chemistry : journal. — 1975. — Vol. 250. — P. 7602—7622. Архивировано 29 марта 2017 года.
- ↑ Warburg, O and Gewitz H S. Cytohämin aus Herzmuskel (неопр.) // Zeitschrift für Physiologische Chemie[англ.]. — 1951. — Т. 288. — С. 1—4. — doi:10.1515/bchm2.1951.288.1.1.
- ↑ Yamashita E., Aoyama H., Yao M., Muramoto K., Shinzawa-Itoh K., Yoshikawa S., Tsukihara T. Absolute configuration of the hydroxyfarnesylethyl group of heme A, determined by X-ray structural analysis of bovine heart cytochrome c oxidase using methods applicable at 2.8 Angstrom resolution (англ.) // Acta Crystallographica D[англ.] : journal. — International Union of Crystallography, 2005. — Vol. 61, no. 10. — P. 1373—1377. — doi:10.1107/S0907444905023358.
- ↑ Tsukihara T., Shimokata K., Katayama Y., Shimada H., Muramoto K., Aoyama H., Mochizuki M., Shinzawa-Itoh K., Yamashita E., Yao M., Ishimura Y., Yoshikawa S. The low-spin heme of cytochrome c oxidase as the driving element of the proton-pumping process (англ.) // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : journal. — 2003. — Vol. 100, no. 26. — P. 15304—15309. — doi:10.1073/pnas.2635097100. — PMID 14673090. — PMC 307562.
- ↑ 1 2 Yoshikawa, S.; Shinzawa-Itoh, K.; Nakashima, R.; Yaono, R.; Yamashita, E.; Inoue, N.; Yao, M.; Fei, M. J.; Peters Libeu, C. Redox-Coupled Crystal Structural Changes in Bovine Heart Cytochrome c Oxidase (англ.) // Science : journal. — 1998. — Vol. 280, no. 5370. — P. 1723—1729. — doi:10.1126/science.280.5370.1723. — PMID 9624044.
- ↑ Shimokata K., Katayama Y., Murayama H., Suematsu M., Tsukihara T., Muramoto K., Aoyama H., Yoshikawa S., Shimada H. The proton pumping pathway of bovine heart cytochrome c oxidase (англ.) // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : journal. — 2007. — Vol. 104, no. 10. — P. 4200—4205. — doi:10.1073/pnas.0611627104. — PMID 17360500. — PMC 1820732.