Ленточная диаграмма (биохимия)

Ленточная диаграмма — схематичное трёхмерное изображение структуры белка. Альфа-спирали на диаграмме изображаются лентами, бета-листы — стрелками, случайные спирали — линиями или тонкими трубками. Направление, в котором рассматривается цепочка, может быть отображено плавным изменением цвета ленты.

Ленточная диаграмма мономера триозофосфатизомеразы, рисунок Джейн Ричардсон

Литература

[править | править код]

Томас Дж. Смит (2005) "Displaying and Analyzing Atomic Structures on the Macintosh". Danforth Plant Science Center.

Ричардсон, Д. С.; Ричардсон, Дж. С. (2002). "Teaching Molecular 3-D Literacy". Biochemistry and Molecular Biology Education. 30 (1): 21–26. doi:10.1002/bmb.2002.494030010005.

Ричардсон, Дж. С. (2000), "Early ribbon drawings of proteins", Nature Structural Biology, 7 (8): 624–625, doi:10.1038/77912, PMID 10932243, S2CID 52856546.

Ричардсон, Дж. С. (1985), Schematic Drawings of Protein Structures, Methods in Enzymology, vol. 115, pp. 359–380, doi:10.1016/0076-6879(85)15026-3, ISBN 978-0-12-182015-2, PMID 3853075.

Ричардсон, Дж. С. (1981), Anatomy and Taxonomy of Protein Structures, Advances in Protein Chemistry, vol. 34, pp. 167–339, doi:10.1016/S0065-3233(08)60520-3, ISBN 978-0-12-034234-1, PMID 7020376.

Артур М. Леск; Карл Д. Хардман. (1982), "Computer-Generated Schematic Diagrams of Protein Structures", Science, 216 (4545): 539–540, Bibcode:1982Sci...216..539L, doi:10.1126/science.7071602, PMID 7071602.

М. Карсон; С. Е. Багг (1986), "Algorithm for Ribbon Models of Proteins", Journal of Molecular Graphics, 4 (2): 121–122, doi:10.1016/0263-7855(86)80010-8.

Ричардсон, Д. C.; Ричардсон, Дж. С. (1992), "The kinemage: a tool for scientific communication", Protein Science, 1 (1): 3–9, doi:10.1002/pro.5560010102, PMC 2142077, PMID 1304880

В. Б. Чен; И. В. Дэвис; Ричардсон Д. C. (2009), "KING (Kinemage, Next Generation): A versatile interactive molecular and scientific visualization program", Protein Science, 18 (11): 2403–2409, doi:10.1002/pro.250, PMC 2788294, PMID 19768809

Томас Д. Годдард; Конрад С. Хуанг; Томас Е. Феррин (2005) "Software Extensions to UCSF Chimera for Interactive Visualization of Large Molecular Assemblies", Structure, 13 (3): 473–482, doi:10.1016/j.str.2005.01.006, PMID 15766548.

Аксел Т. Брангер; Джеймс. А. Веллс (2009), "Warren L. DeLano, 21 June 1972-3 November 2009", Nature Structural & Molecular Biology, 16 (12): 1202–1203, doi:10.1038/nsmb1209-1202, PMID 19956203.