TNP1

TNP1
Идентификаторы
ПсевдонимыTNP1, TP1, transition protein 1
Внешние IDOMIM: 190231 MGI: 98784 HomoloGene: 136517 GeneCards: TNP1
Расположение гена (человек)
2-я хромосома человека
Хр.2-я хромосома человека[1]
2-я хромосома человека
Расположение в геноме TNP1
Расположение в геноме TNP1
Локус2q35Начало216,859,458 bp[1]
Конец216,860,064 bp[1]
Расположение гена (Мышь)
1-я хромосома мыши
Хр.1-я хромосома мыши[2]
1-я хромосома мыши
Расположение в геноме TNP1
Расположение в геноме TNP1
Локус1 C3|1 36.94 cMНачало73,054,233 bp[2]
Конец73,055,068 bp[2]
Паттерн экспрессии РНК
Bgee
ЧеловекМышь (ортолог)
Наибольшая экспрессия в
Наибольшая экспрессия в
Дополнительные справочные данные
BioGPS
Дополнительные справочные данные
Генная онтология
Молекулярная функция
Компонент клетки
Биологический процесс
Источники: Amigo, QuickGO
Ортологи
ВидЧеловекМышь
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (мРНК)

NM_003284

NM_009407

RefSeq (белок)

NP_003275

NP_033433

Локус (UCSC)Chr 2: 216.86 – 216.86 MbChr 1: 73.05 – 73.06 Mb
Поиск по PubMedИскать[3]Искать[4]
Логотип Викиданных Информация в Викиданных
Смотреть (человек)Смотреть (мышь)

Переходный ядерный белок сперматид номер один (англ. Spermatid nuclear transition protein 1) — белок, который у человека кодируется геном TNP1[5][6]. Данный белок имеет центральное значение в сперматогенезе. Мутации в этом гене могут вызывать нарушения образования сперматозоидов, тем самым приводя к бесплодию[7]. Белок TNP1 состоит из 54 остатков аминокислот с общей молекулярной массой 6,2 кДа. Аминокислоты аргинин и лизин распределены равномерно и составляют около 40% белка. Цистеин отсутствует. Исследования in vitro показали, что белок TNP1 снижает температуру плавления ДНК, высвобождая ее из нуклеосом[8]. В удлиняющихся сперматозоидах млекопитающих участвует в замене гистонов на протамин[9].

Примечания

[править | править код]
  1. 1 2 3 GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000118245 - Ensembl, May 2017
  2. 1 2 3 GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000026182 - Ensembl, May 2017
  3. Ссылка на публикацию человека на PubMed: Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  4. Ссылка на публикацию мыши на PubMed: Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  5. Luerssen H., Mattei M. G., Schroter M., Grzeschik K. H., Adham I. M., Engel W. Nucleotide sequence of the gene for human transition protein 1 and its chromosomal localization on chromosome 2 (англ.) // Genomics : journal. — Academic Press, 1991. — January (vol. 8, no. 2). — P. 324—330. — doi:10.1016/0888-7543(90)90289-7. — PMID 2249851.
  6. Entrez Gene: TNP1 transition protein 1 (during histone to protamine replacement). Архивировано 5 декабря 2010 года.
  7. Shuai Zhang, Yan Zhang, Chunhong Yang, Wei Zhang, Zhihua Ju. TNP1 Functional SNPs in bta-miR-532 and bta-miR-204 Target Sites Are Associated with Semen Quality Traits in Chinese Holstein Bulls1 (англ.) // Biology of Reproduction. — 2015-06-01. — Vol. 92, iss. 6. — ISSN 1529-7268 0006-3363, 1529-7268. — doi:10.1095/biolreprod.114.126672.
  8. Torres-Flores U., Hernández-Hernández A. The Interplay Between Replacement and Retention of Histones in the Sperm Genome (англ.) // Frontiers in Genetics. — 2020. — Vol. 11. — P. 780. — ISSN 1664-8021. — doi:10.3389/fgene.2020.00780.
  9. UniProtKB - P09430 (STP1_HUMAN) (англ.). uniprot. Дата обращения: 3 января 2021. Архивировано 7 мая 2021 года.