Gobernador | Número | Período | Partido político | Notas |
| | José Pantaleón Domínguez | 28.º | 1 de diciembre de 1864 - 4 de septiembre de 1866 | | Gobernó la parte del estado no controlada por las tropas francesas-conservadoras, y en disputa con Albino Corzo entre septiembre y diciembre de 1866. |
| | Ángel Albino Corzo | 7.º Mandato | 4 de septiembre de 1866 - 1 de diciembre de 1866 | Partido Liberal | En disputa con Pantaleón Domínguez. |
| | José Pantaleón Domínguez | - | 1 de diciembre de 1864 - 30 de noviembre de 1875 | | Gobernó la parte del estado no controlada por las tropas francesas-conservadoras, y en disputa con Albino Corzo entre septiembre y diciembre de 1866. |
| | Moisés Rojas | 29.º | 1 de diciembre de 1875 - 21 de marzo de 1876 | | Gobernador Interino. |
| | Carlos Borda | 30.º | 21 de marzo de 1876 - 18 de marzo de 1877 | | |
| | Diego Betanzos | 31.º | 18 de marzo de 1877 - 11 de abril de 1877 | | Gobernador Interino. |
| | Mariano Nicolás Ruíz | 2.º Mandato | 11 de abril de 1877 - 1 de diciembre de 1877 | | Gobernador Interino. |
| | Sebastián Escobar | 32.º | 1 de diciembre de 1877 - 29 de julio de 1878 | Partido Liberal | Gobernador Interino. |
| | Mariano José Aguilar Rodas | 33.º | 29 de julio de 1878 - 1 de diciembre de 1879 | Partido Liberal | Gobernador Interino. |
| | Miguel Utrilla Trujillo | 34.º | 1 de diciembre de 1879 - 1 de diciembre de 1883 | Partido Liberal | |
| | José María Ramírez | 35.º | 1 de diciembre de 1883 - 30 de noviembre de 1887 | Partido Liberal | |
| | Manuel Carrascosa | 36.º | 1 de diciembre de 1887 - 30 de noviembre de 1891 | Partido Liberal | |
| | Emilio Rabasa Estebanell | 37.º | 1 de diciembre de 1891 - 26 de febrero de 1894 | Partido Liberal | |
| | Fausto Moguel | 38.º | 27 de febrero de 1894 - 30 de noviembre de 1895 | Partido Liberal | |
| | Francisco León | 39.º | 1 de diciembre de 1895 - 11 de octubre de 1899 | Partido Liberal | |
| | Rafael Pimentel | 47.º | 12 de octubre de 1899 - 25 de diciembre de 1905 | Partido Liberal | |
| | Ramón Rabasa | 48.º | 26 de diciembre de 1905 - 2 de junio de 1911 | Partido Liberal | |
| | Manuel Trejo | 49.º | 2 de junio de 1911 - 3 de julio de 1911 | | Gobernador Interino |
| | Reynaldo Gordillo León | 50.º | 4 de julio de 1911 - 11 de julio de 1911 | | Gobernador Provisional |
| | Policarpo Rueda Fernández | 51.º | 12 de julio de 1911 - 20 de agosto de 1911 | | Gobernador Interino |
| | Manuel Rovelo Argüello | 52.º | 21 de agosto de 1911 - 28 de agosto de 1911 | | Gobernador Interino |
| | Marco Aurelio Solís | 53.º | 28 de agosto de 1911 - 15 de diciembre de 1911 | | Gobernador Interino |
| | Reynaldo Gordillo León | 2.º Mandato | 15 de diciembre de 1911 - 28 de enero de 1912 | | Gobernador Interino |
| | Flavio Guillén | 54.º | 29 de enero de 1912 - 6 de febrero de 1913 | | Gobernador Interino |
| | Marco Aurelio Solís | 2.º Mandato | 6 de febrero de 1913 - 20 de marzo de 1913 | | Gobernador Interino |
| | Reynaldo Gordillo León | 3.º Mandato | 21 de marzo de 1913 - 18 de julio de 1913 | | Gobernador Interino |
| | Bernardo Palafox | 59.º | 19 de julio de 1913 - 13 de agosto de 1914 | Militar | Gobernador Interino |
| | José Inés Cano | 60.º | 14 de agosto de 1914 - 13 de septiembre de 1914 | | Gobernador Interino |
| | Jesús Agustín Castro | 61.º | 13 de septiembre de 1914 - 24 de septiembre de 1914 | Militar | Gobernador Interino |
| | Blas Corral | 62.º | 25 de septiembre de 1914 - 24 de octubre de 1914 | Militar | |
| | Jesús Agustín Castro | 2.º Mandato | 25 de octubre de 1914 - 4 de abril de 1915 | Militar | |
| | Blas Corral | 2.º Mandato | 5 de abril de 1915 - 9 de mayo de 1915 | Militar | |
| | Jesús Agustín Castro | 3.º Mandato | 10 de mayo de 1915 - 28 de mayo de 1915 | Militar | |
| | Blas Corral | 3.º Mandato | 29 de mayo de 1915 - 12 de abril de 1916 | Militar | |
| | José Ascensión González | 63.º | 13 de abril de 1916 - 24 de mayo de 1916 | Militar | |
| | Blas Corral | 4.º Mandato | 25 de mayo de 1916 - 24 de septiembre de 1916 | Militar | Gobernador Interino |
| | Pablo Villanueva | 64.º | 25 de septiembre de 1916 - 17 de diciembre de 1917 | Militar | Gobernador Interino |
| | Manuel Fuentes | 65.º | 18 de diciembre de 1917 - 5 de marzo de 1918 | | |
| | Pablo Villanueva | 2.º Mandato | 6 de marzo de 1918 - 6 de mayo de 1919 | Militar | |
| | Manuel Fuentes | 2.º Mandato | 7 de mayo de 1919 - 9 de julio de 1919 | | |
| | Pablo Villanueva | 3.º Mandato | 9 de julio de 1919 - 1 de diciembre de 1919 | Militar | |
| | Pascual Morales Molina | 66.º | 2 de diciembre de 1919 - 8 de marzo de 1920 | Militar | Gobernador Interino |
| | Alejo González | 67.º | 9 de marzo de 1920 - 18 de mayo de 1920 | Militar | |
| | Francisco G. Ruíz | 68.º | 18 de mayo de 1920 - 12 de julio de 1920 | Militar | |
| | Fausto Ruíz | 69.º | 13 de julio de 1920 - 16 de agosto de 1920 | Militar | |
| | Francisco G. Ruíz | 2.º Mandato | 17 de agosto de 1920 - 20 de noviembre de 1920 | Militar | |
| | Amadeo Ruíz | 70.º | 21 de noviembre de 1920 - 30 de noviembre de 1920 | | Gobernador Interino |
| | Tiburcio Fernández Ruíz | 72.º | 1 de diciembre de 1920 - 5 de abril de 1924 | Militar | |
| | Luis García | 73.º | 6 de abril de 1924 - 24 de septiembre de 1924 | | |
| | Martín Paredes | 74.º | 25 de septiembre de 1924 - 9 de octubre de 1924 | | |
| | Tiburcio Fernández Ruíz | 2.º Mandato | 10 de octubre de 1924 - 30 de noviembre de 1924 | Militar | |
| | Raúl de León | 75.º | 1 de diciembre de 1924 - diciembre de 1924 | | Gobernador Interino, no reconocido por el gobierno federal. |
| | Luis Ramírez Corzo | 76.º | Diciembre de 1924 - 31 de diciembre de 1924 | | Gobernador Interino, no reconocido por el gobierno federal. |
| | César Córdova | 77.º | 1 de enero de 1925 - 19 de mayo de 1925 | | Gobernador Interino |
| | Carlos A. Vidal | 78.º | 20 de mayo de 1925 - 22 de mayo de 1927 | | |
| | Luis P. Vidal | 79.º | 23 de mayo de 1927 - 3 de octubre de 1927 | Militar | Gobernador Interino |
| | Manuel Álvarez Rábago | 80.º | 4 de octubre de 1927 - 30 de octubre de 1927 | Militar | Gobernador Interino |
| | Federico Martínez Rojas | 81.º | 31 de octubre de 1927 - 30 de marzo de 1928 | | Gobernador Interino |
| | Amador Coutiño de Coss | 82.º | 31 de marzo de 1928 - 9 de noviembre de 1928 | | |
| | Rosendo Delarbre Santeliz | 83.º | 10 de noviembre de 1928 - 30 de noviembre de 1928 | | Gobernador Interino |
| | Raymundo E. Enríquez | 84.º | 1 de diciembre de 1928 - 30 de noviembre de 1932[nota 1] | | |
| | Victórico Grajales Reynosa | 85.º | 1 de diciembre de 1932 - 1 de julio de 1936 | Partido Nacional Revolucionario | |
| | Martín G. Cruz | 86.º | 1 de julio de 1936 - 24 de agosto de 1936 | Partido Nacional Revolucionario | Gobernador Provisional. |
| | Victórico Grajales Reynosa | 2.º Mandato | 24 de agosto de 1836 - 22 de septiembre de 1936 | Partido Nacional Revolucionario | |
| | Amador Coutiño de Coss | 2.º Mandato | 23 de septiembre de 1936 - 15 de diciembre de 1936 | Partido Nacional Revolucionario | |
| | Efraín A. Gutiérrez | 87.º | 15 de diciembre de 1936 - 30 de noviembre de 1940 | Partido de la Revolución Mexicana | |
| | Rafael Pascacio Gamboa | 88.º | 1 de diciembre de 1940 - 30 de noviembre de 1944 | Partido de la Revolución Mexicana | |
| | Juan María Esponda | 89.º | 1 de diciembre de 1944 - 6 de enero de 1947 | Partido de la Revolución Mexicana | Gobernador Interino |
| | César Augusto Lara Ramos | 90.º | 7 de enero de 1947 - 30 de noviembre de 1948 | Partido Revolucionario Institucional | Gobernador Interino |
| | Francisco J. Grajales | 91.º | 1 de diciembre de 1948 - 30 de noviembre de 1952 | Partido Revolucionario Institucional | |
| | Efraín Aranda Osorio | 92.º | 1 de diciembre de 1952 - 30 de noviembre de 1958 | Partido Revolucionario Institucional | |
| | Samuel León Brindis | 93.º | 1 de diciembre de 1958 - 30 de noviembre de 1964 | Partido Revolucionario Institucional | |
| | José Castillo Tielemans | 94.º | 1 de diciembre de 1964 - 30 de noviembre de 1970 | Partido Revolucionario Institucional | |
| | Manuel Velasco Suárez | 95.º | 1 de diciembre de 1970 - 30 de noviembre de 1976 | Partido Revolucionario Institucional | |
| | Jorge de la Vega Domínguez | 96.º | 1 de diciembre de 1976 - 9 de diciembre de 1977 | Partido Revolucionario Institucional | |
| | Salomón González Blanco | 97.º | 9 de diciembre de 1977 - 29 de noviembre de 1979 | Partido Revolucionario Institucional | Gobernador Interino |
| | Juan Sabines Gutiérrez | 98.º | 29 de noviembre de 1979 - 30 de noviembre de 1982 | Partido Revolucionario Institucional | Gobernador Interino |
| | Gustavo Armendáriz Ruíz | 99.º | 1 de diciembre de 1982 - 8 de diciembre de 1982 | Partido Revolucionario Institucional | |
| | Absalón Castellanos Domínguez | 100.º | 8 de diciembre de 1982 - 30 de noviembre de 1988 | Partido Revolucionario Institucional | |
| | José Patrocinio González Blanco Garrido | 101.º | 1 de diciembre de 1988 - 4 de enero de 1993 | Partido Revolucionario Institucional | |
| | Elmar Setzer Marseille | 102.º | 4 de enero de 1993 - 18 de enero de 1994 | Partido Revolucionario Institucional | Gobernador Interino |
| | Javier López Moreno | 103.º | 18 de enero de 1994 - 10 de diciembre de 1994 | Partido Revolucionario Institucional | Gobernador Interino |
| | Eduardo Robledo Rincón | 104.º | 10 de diciembre de 1994 - 17 de febrero de 1995 | Partido Revolucionario Institucional | Gobernador Interino |
| | Julio César Ruiz Ferro | 105.º | 17 de febrero de 1995 - 7 de enero de 1998 | Partido Revolucionario Institucional | Gobernador Interino |
| | Roberto Albores Guillén | 106.º | 7 de enero de 1998 - 8 de diciembre de 2000 | Partido Revolucionario Institucional | Gobernador Interino |
| | Pablo Abner Salazar Mendiguchía | 107.º | 8 de diciembre de 2000 - 7 de diciembre de 2006 | Partido de la Revolución Democrática | Primer gobernador del estado ajeno al PRI desde 1929. |
| | Juan Sabines Guerrero | 108.º | 8 de diciembre de 2006 - 7 de diciembre de 2012 | Partido de la Revolución Democrática | |
| | Manuel Velasco Coello | 109.º | 8 de diciembre de 2012 - 29 de agosto de 2018 | Partido Verde Ecologista de México | |
| | Willy Ochoa Gallegos | 110.º | 30 de agosto de 2018 - 4 de septiembre de 2018 | Partido Revolucionario Institucional | Gobernador Provisional |
| | Manuel Velasco Coello | 2.º Mandato | 5 de septiembre de 2018 - 7 de diciembre de 2018 | Partido Verde Ecologista de México | |
| | Rutilio Escandón Cadenas | 111.º | Desde el 8 de diciembre de 2018 | Movimiento de Regeneración Nacional | |