Metaboloma

El metaboloma es el conjunto completo de las pequeñas moléculas denominadas metabolitos (tales como intermediarios metabólicos, hormonas y otras moléculas de señalización, y metabolitos secundarios) que se pueden encontrar en una muestra biológica, tal como un organismo. El vocablo se acuñó en analogía con transcriptómica y proteómica. Como el transcriptoma y el proteoma, el metaboloma es dinámico, y cambia segundo a segundo. Aunque el metabaloma puede definirse de forma bastante sencilla, actualmente no es posible analizar el rango completo de metabolitos mediante un único método analítico (ver metabolómica). En enero de 2007, científicos de la Universidad de Alberta y de la Universidad de Calgary concluyeron el borrador del metaboloma humano, catalogando y caracterizando 2500 metabolitos, 1200 principios activos, y 3500 componentes que pueden encontrarse en el cuerpo humano.

• Bioinformática
• Espectrómetro de masas
• Electroforesis proteica
• Pfam
• Proteoma
• Secuenciación de proteínas
• Swiss-Prot

• Proteome.org
• Proyecto Metaboloma Humano
• Base de datos del Metaboloma Humano
• Biblioteca del Metabolito Humano
• Estándars de estudios metabolómicos
• Los científicos completan el metaboloma humano

• Primer uso del término metaboloma en la literatura — Oliver SG, Winson MK, Kell DB, Baganz F (septiembre de 1998). «Systematic functional analysis of the yeast genome». Trends Biotechnol. 16 (9): 373-8. PMID 9744112. doi:10.1016/S0167-7799(98)01214-1. 
• Primer libro sobre metabolómica — Harrigan, G. G. & Goodacre, R. (eds) (2003). RMetabolic Profiling: Its Role in Biomarker Discovery and Gene Function Analysis. Kluwer Academic Publishers (Boston). ISBN xxx-xxx. 
• Fiehn O, Kloska S, Altmann T (febrero de 2001). «Integrated studies on plant biology using multiparallel techniques». Curr. Opin. Biotechnol. 12 (1): 82-6. PMID 11167078. doi:10.1016/S0958-1669(00)00165-8. 
• Fiehn O (2001). «Combining genomics, metabolome analysis, and biochemical modelling to understand metabolic networks». Comp. Funct. Genomics 2 (3): 155-68. PMC 2447208. PMID 18628911. doi:10.1002/cfg.82. 
• Weckwerth W (2003). «Metabolomics in systems biology». Annu Rev Plant Biol 54: 669-89. PMID 14503007. doi:10.1146/annurev.arplant.54.031902.135014. 
• Goodacre R, Vaidyanathan S, Dunn WB, Harrigan GG, Kell DB (mayo de 2004). «Metabolomics by numbers: acquiring and understanding global metabolite data». Trends Biotechnol. 22 (5): 245-52. PMID 15109811. doi:10.1016/j.tibtech.2004.03.007. 
• Wishart DS, Tzur D, Knox C, Eisner R, Guo AC, Young N, Cheng D, Jewell K, Arndt D, Sawhney S, Fung C, Nikolai L, Lewis M, Coutouly M-A, Forsythe I, Tang P, Shrivastava S, Jeroncic K, Stothard P, Amegbey G, Block D, Hau DD, Wagner J, Miniaci J, Clements M, Gebremedhin M, Guo N, Zhang Y, Duggan GE, MacInnis GD, Weljie AM, Dowlatabadi R, Bamforth F, Clive D, Greiner R, Li L, Marrie T, Sykes BD, Vogel HJ, Querengesser L (enero de 2007). «HMDB: The Human Metabolome Database». Nucleic Acids Research. 35 (Database issue) (Database issue): D521-6. PMC 1899095. PMID 17202168. doi:10.1093/nar/gkl923. 
• Wishart DS, Knox C, Guo AC, Eisner R, Young N, Gautam B, Hau DD, Psychogios N, Dong E, Bouatra S, Mandal R, Sinelnikov I, Xia J, Jia L, Cruz JA, Lim E, Sobsey CA, Shrivastava S, Huang P, Liu P, Fang L, Peng J, Fradette R, Cheng D, Tzur D, Clements M, Lewis A, De Souza A, Zuniga A, Dawe M, Xiong Y, Clive D, Greiner R, Nazyrova A, Shaykhutdinov R, Li L, Vogel HJ, Forsythe I (enero de 2009). «HMDB: a knowledgebase for the human metabolome». Nucleic Acids Research. 37 (Database issue) (Database issue): D603-10. PMC 2686599. PMID 18953024. doi:10.1093/nar/gkn810. 
• Nicholson JK, Holmes E, Lindon JC, Wilson ID (octubre de 2004). «The challenges of modeling mammalian biocomplexity». Nat. Biotechnol. 22 (10): 1268-74. PMID 15470467. doi:10.1038/nbt1015. . Stresses the role of intestinal microorganisms in contributing to the human metabolome.
• van der Greef J, Stroobant P, van der Heijden R (octubre de 2004). «The role of analytical sciences in medical systems biology». Curr Opin Chem Biol 8 (5): 559-65. PMID 15450501. doi:10.1016/j.cbpa.2004.08.013. 
• Kell DB (junio de 2004). «Metabolomics and systems biology: making sense of the soup». Curr. Opin. Microbiol. 7 (3): 296-307. PMID 15196499. doi:10.1016/j.mib.2004.04.012. 
• Dunn, W.B. and Ellis, D.I. (2005) Metabolomics: current analytical platforms and methodologies. Trends in Analytical Chemistry 24(4), 285-294.
• Ellis DI, Goodacre R (agosto de 2006). «Metabolic fingerprinting in disease diagnosis: biomedical applications of infrared and Raman spectroscopy». Analyst 131 (8): 875-85. PMID 17028718. doi:10.1039/b602376m.