Sebastian Jakubiak (Lübeck, 21 juni 1993) is een Duits voetballer die doorgaans als middenvelder speelt. Medio 2017 verruilde hij SV Rödinghausen voor Heracles Almelo.
Jakubiak speelde in de jeugd voor Hamburger SV en VfB Lübeck. Voor VfB Lübeck debuteerde hij op elf november 2011 in de Regionalliga Nord in de thuiswedstrijd tegen SV Wilhelmshaven (0-3) als invaller na 67 minuten voor Dominic Hartmann. Tussen 2013 en 2015 speelde Jakubiak in dezelfde competitie voor het tweede team van FC St. Pauli. Van 2015 tot 2017 speelde hij in de Regionalliga West voor SV Rödinghausen. Jakubiak ondertekende op 14 juli 2017 een tweejarig contract met een optie op nog een seizoen bij Heracles Almelo. Hij debuteerde op 3 december 2017 in de uitwedstrijd in de Eredivisie tegen Willem II als invaller na 86 minuten voor Jamiro Monteiro. Dertien seconden later zette Jakubiak de 3-1 eindstand op het scorebord.