Mini Jakobsen startade sin karriär i Bodø/Glimt 1984 som då spelade i Adeccoligaen. 1986 gick laget upp till Tippeligaen. Under sin tid i Bodø/Glimt blev Jakobsen lagets bäste målskytt fyra år i rad. 1988 såldes Jakobsen till Rosenborg BK där han under sin första säsong vann både Tippeligaen och den norska cupen.