巴塔哥尼亚爪龙复原图 
巴塔哥尼亚爪龙（右）与鸟面龙（左）的标本对比 巴塔哥尼亞爪龍屬（學名：Patagonykus）意為「巴塔哥尼亞的爪」，是一屬獸腳亞目恐龍，生存於上白堊紀的阿根廷。这一阿瓦拉慈龙类恐龍的化石发现于阿根廷巴塔哥尼亞地区內烏肯省的内乌肯沉积盆地，地質年代為里奥内乌肯亚群的波特苏埃洛组（土侖期到康尼亞克期）。正模標本包含了一組不完整但保存很好的骨骼，包括很多脊椎、鳥喙骨、部份前肢、骨盆及後肢，只缺少了頭骨。巴塔哥尼亞爪龍被分類在阿瓦拉慈龍科，這類恐龍包括有蒙古的單爪龍及阿根廷的阿瓦拉慈龍[1][2]。本屬模式种普氏巴塔哥尼亚爪龙的种加词（peuratai）意在致谢埃吉迪奥·费鲁利奥古生物博物馆的技术员巴勃罗·F·普埃尔塔对标本发掘做出的贡献[2]。2010年，格雷戈里·S·保罗估计巴塔哥尼亞爪龍体长約有1米，体重3.5千克[3]。
阿尼奥林等（2012）最初将巴塔哥尼亚爪龙属置于阿瓦拉慈龙类科里，位于巴塔哥尼亚爪龙亚科并作为波氏爪龙亚科的姐妹群[4]。 马科维基、阿佩斯特吉亚和贾内基尼（2012）发现巴塔哥尼亚爪龙应位于一个包括纤腿龙、波氏爪龙亚科及一个包括更深层嵌套类群演化支（如临河爪龙、单爪龙和游光爪龙）的多歧分支[5]。然而徐星等（2018）将该属置于基干阿瓦拉慈龙超科，与阿基里斯龙和阿瓦拉慈龙科这一演化支为姐妹群，并与之组成波氏爪龙的姐妹群，福勒等（2020）与秦子川等（2019）的复原也支持这一观点[6][7][8]。而在阿韦里亚诺夫与洛帕京（2020）的研究中，巴塔哥尼亚爪龙在阿瓦拉慈龙科之外仅与波氏爪龙为姐妹群·[9]。
以下为富勒等（2020）的系统发生学研究[7]。
以下为阿尼奥林等（2012）较早的研究结果[4]。
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