RET (タンパク質)

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RET
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2IVS, 2IVT, 2IVU, 2IVV, 2X2K, 2X2L, 2X2M, 2X2U, 4CKI, 4CKJ, 4UX8, 5AMN

識別子
記号RET, Ret, PTC, RET51, RET9, c-Ret, CDHF12, CDHR16, HSCR1, MEN2A, MEN2B, MTC1, RET-ELE1, ret proto-oncogene
外部IDOMIM: 164761 MGI: 97902 HomoloGene: 7517 GeneCards: RET
遺伝子の位置 (ヒト)
10番染色体 (ヒト)
染色体10番染色体 (ヒト)[1]
10番染色体 (ヒト)
RET遺伝子の位置
RET遺伝子の位置
バンドデータ無し開始点43,077,064 bp[1]
終点43,130,351 bp[1]
遺伝子の位置 (マウス)
6番染色体 (マウス)
染色体6番染色体 (マウス)[2]
6番染色体 (マウス)
RET遺伝子の位置
RET遺伝子の位置
バンドデータ無し開始点118,128,706 bp[2]
終点118,174,679 bp[2]
RNA発現パターン




さらなる参照発現データ
遺伝子オントロジー
分子機能 トランスフェラーゼ活性
ヌクレオチド結合
calcium ion binding
protein kinase activity
キナーゼ活性
血漿タンパク結合
protein tyrosine kinase activity
ATP binding
シグナル伝達受容体活性
transmembrane receptor protein tyrosine kinase activity
受容体型チロシンキナーゼ
膜貫通シグナル伝達受容体活性
細胞の構成要素 integral component of membrane
エンドソーム
intracellular membrane-bounded organelle

receptor complex
integral component of plasma membrane
神経繊維
soma
樹状突起
early endosome
脂質ラフト
endosome membrane
細胞膜
細胞質基質
plasma membrane protein complex
細胞質
生物学的プロセス cellular response to retinoic acid
ureteric bud development
embryonic epithelial tube formation
membrane protein proteolysis
リン酸化
transmembrane receptor protein tyrosine kinase signaling pathway
positive regulation of cell migration
neuron cell-cell adhesion
神経系発生
neuron maturation
positive regulation of metanephric glomerulus development
positive regulation of transcription, DNA-templated
regulation of axonogenesis
タンパク質リン酸化
腸管神経系発生
positive regulation of extrinsic apoptotic signaling pathway in absence of ligand
regulation of cell adhesion
lymphocyte migration into lymphoid organs
細胞接着
positive regulation of gene expression
ureter maturation
response to pain
retina development in camera-type eye
neural crest cell migration
neuron differentiation
positive regulation of cell size
positive regulation of neuron projection development
posterior midgut development
positive regulation of cell adhesion mediated by integrin
神経支配
positive regulation of neuron maturation
activation of cysteine-type endopeptidase activity involved in apoptotic process
シグナル伝達
homophilic cell adhesion via plasma membrane adhesion molecules
Peyer's patch morphogenesis
peptidyl-tyrosine phosphorylation
MAPK cascade
軸索誘導
positive regulation of peptidyl-serine phosphorylation of STAT protein
glial cell-derived neurotrophic factor receptor signaling pathway
positive regulation of MAPK cascade
positive regulation of protein kinase B signaling
negative regulation of signal transduction
細胞分化
negative regulation of apoptotic process
positive regulation of ERK1 and ERK2 cascade
神経発生
出典:Amigo / QuickGO
オルソログ
ヒトマウス
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq
(mRNA)

NM_000323
NM_020629
NM_020630
NM_020975
NM_001355216

NM_001080780
NM_009050

RefSeq
(タンパク質)

NP_065681
NP_066124
NP_001342145
NP_066124.1

NP_001074249
NP_033076

場所
(UCSC)
Chr 10: 43.08 – 43.13 MbChr 10: 118.13 – 118.17 Mb
PubMed検索[3][4]
ウィキデータ
閲覧/編集 ヒト閲覧/編集 マウス

RETGDNFファミリーの細胞外シグナル伝達分子を結合する受容体型チロシンキナーゼであり、ヒトではRET遺伝子にコードされる[5]RET遺伝子の機能喪失型変異はヒルシュスプルング病の発症と関係しており[6]、機能獲得型変異は甲状腺髄様癌英語版多発性内分泌腺腫症2A型と2B型を含む、さまざまなタイプのがんの発症と関係している[7]

構造

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RETは"rearranged during transfection"の略であり、この遺伝子のDNA配列はもともと、3T3線維芽細胞株をヒトリンパ腫細胞由来のDNAでトランスフェクションした際に再編成が起こっている領域として発見された[8]。ヒトのRET遺伝子は10番染色体英語版(10q11.2)に位置しており、21個のエクソンからなる[9]

RET遺伝子からは選択的スプライシングによって3つの異なるタンパク質アイソフォームが産生される。RET51、RET43、RET9はC末端のテールがそれぞれ51、43、9アミノ酸からなる[10]。一般的なアイソフォームはRET51とRET9で、in vivoでの生物学的役割が最もよく研究されている。

各アイソフォームは共通のドメイン構造を持ち、4つのカドヘリン様リピートとシステインリッチ領域からなるN末端の細胞外ドメイン、疎水的な膜貫通ドメイン、細胞質側のチロシンキナーゼドメインから構成される。チロシンキナーゼドメインは27アミノ酸からなる挿入配列によって分割されている。RET9、18、51のチロシンキナーゼドメイン内には16個のチロシン(Tyr)が存在する。Tyr1090とTyr1096はRET51アイソフォームにのみ存在する[11]

RETの細胞外ドメインには9つのN-グリコシル化部位が存在する。完全にグリコシル化されたRETタンパク質は170 kDaであるとの報告があるが、どのアイソフォームに対応するものであるかは明らかではない[12]

キナーゼの活性化

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RETはGDNFファミリーリガンド(GFL)に対する受容体である[13]

RETを活性化するためには、GFLはまずGPIアンカーで膜に固定されたコレセプターと複合体を形成する必要がある。コレセプター自身はGFRα英語版(GDNF receptor-α)タンパク質ファミリーに分類される。さまざまなGFRαファミリーのメンバー(GFRα1英語版GFRα2英語版GFRα3英語版GFRα4英語版)は、それぞれ特定のGFLに対して特異的な結合活性を示す[14]。GFL-GFRα複合体が形成されると、複合体は2つのRET分子を結合させ、各RET分子のチロシンキナーゼドメイン内の特定のチロシン残基のトランス自己リン酸化を開始させる。キナーゼドメインの活性化ループ(Aループ)に位置するTyr900とTyr905が自己リン酸化部位であることは質量分析によって示されている[15]。Tyr905のリン酸化はキナーゼの活性型コンフォメーションを安定化し、主にC末端のテール領域に位置する他のチロシン残基の自己リン酸化を引き起こす[11]

発生におけるRETシグナル伝達の役割

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GDNF、GFRα1またはRETタンパク質自身を欠損したマウスは、腎臓腸管神経系英語版の発生に重大な欠陥が生じる。このことは、RETシグナルの伝達が腎臓と腸管神経系の正常な発生に重要であることを示唆している[11]

臨床的意義

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RETの活性化型点変異によって、多発性内分泌腫瘍症2型英語版(MEN2)と呼ばれる遺伝性がん症候群が生じる[16]。臨床症状によって、MEN2A、MEN2B、家族性甲状腺髄様癌(FMTC)の3つのサブタイプが存在する[7]。点変異の位置と疾患の表現型の間には高度の相関がみられる。

染色体再編成によってRETタンパク質のC末端領域が他のタンパク質のN末端部分に並置された融合遺伝子が生じることで、RETのキナーゼ活性の恒常的な活性化が引き起こされることがある。このようなタイプの変異は甲状腺乳頭癌英語版と関係しており、形成される融合がんタンパク質はRET/PTCタンパク質と呼ばれている[17]

疾患データベース

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ユタ大学RET遺伝子の変異データベースでは、2020年1月時点で199種類の変異が同定されている。

相互作用

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RETは次に挙げる因子と相互作用することが示されている。

出典

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  1. ^ a b c GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000165731 - Ensembl, May 2017
  2. ^ a b c GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000030110 - Ensembl, May 2017
  3. ^ Human PubMed Reference:
  4. ^ Mouse PubMed Reference:
  5. ^ “Structure and chemical inhibition of the RET tyrosine kinase domain”. J. Biol. Chem. 281 (44): 33577–87. (2006). doi:10.1074/jbc.M605604200. PMID 16928683. 
  6. ^ Martucciello, G.; Ceccherini, I.; Lerone, M.; Jasonni, V. (2000-07). “Pathogenesis of Hirschsprung's disease”. Journal of Pediatric Surgery 35 (7): 1017–1025. doi:10.1053/jpsu.2000.7763. ISSN 0022-3468. PMID 10917288. https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/10917288. 
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  11. ^ a b c “RET tyrosine kinase signaling in development and cancer”. Cytokine Growth Factor Rev. 16 (4–5): 441–67. (2005). doi:10.1016/j.cytogfr.2005.05.010. PMID 15982921. 
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関連文献

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外部リンク

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