Anelloviridae

Из Википедии, бесплатной энциклопедии

Anelloviridae
Научная классификация
Группа:
Семейство:
Anelloviridae
Международное научное название
Anelloviridae
Группа по Балтимору
II: оцДНК-вирусы

Anelloviridae  (лат.)семейство ДНК-содержащих вирусов неясного систематического положения. Представители семейства инфицируют позвоночных (в том числе и человека, по всей видимости, бессимптомно) и имеют капсид без оболочки с икосаэдрическим типом симметрии. Геном представлен одноцепочечной молекулой ДНК отрицательной полярности длиной от 2 до 4 тысяч нуклеотидов, замкнутой в кольцо[en]. Репликация происходит по механизму катящегося кольца с участием ДНК-полимеразы клетки-хозяина. В семейство входит примерно 200 видов вирусов.

Этимология названия[править | править код]

Латинское название семейства образовано от итал. anello — кольцо, так как представители семейства имеют кольцевые геномы, представленные одноцепочечной ДНК (оцДНК)[2].

Описание[править | править код]

Члены семейства Anelloviridae имеют капсид без оболочки с икосаэдрическим типом симметрии и числом триангуляции, равным 1. Один капсид состоит из 60 копий капсидного белка (VP1)[3].

Геномы представителей семейства несегментированы и представлены кольцевой одноцепочечной молекулой ДНК отрицательной полярности. Общая длина генома составляет от 2 до 4 тысяч нуклеотидов[3]. В составе генома имеется некодирующий участок, включающий одну или две последовательности длиной 80—110 нуклеотидов. Эти последовательности имеют высокий GC-состав и формируют вторичные структуры, включающие стебли и петли[4]. В целом члены Anelloviridae характеризуются высокой степенью генетического разнообразия. В составе генома имеются две основные открытые рамки считывания, обозначаемые ORF1 и ORF2, их трансляция начинается с разных старт-кодонов[5]. ORF1 даёт начало двум белкам: предполагаемому белку капсида (VP1) и белку, задействованному в репликации[6]. Второй белок, вероятно, является эндонуклеазой, запускающей репликацию по механизму катящегося кольца[7]. Считается, что ORF2 кодирует или белок с фосфатазной активностью (VP2), или белок, подавляющий сигнальный путь NF-κB[8] (VP3). VP3, также известный как апоптин, запускает апоптоз только в злокачественных клетках[3]. Синтез разных белков с одной открытой рамки считывания возможен благодаря альтернативному сплайсингу[9]. В некоторых случаях имеются дополнительные рамки считывания, которые могут перекрываться[4]. В геномах Anelloviridae закодировано в общей сложности 3—4 белка. Белки, кодируемые вирусами семейства Anelloviridae, не имеют гомологов среди каких-либо других белковых последовательностей, поэтому филогенетическое положение Anelloviridae остаётся неясным[7].

Репликация генома у членов Anelloviridae, по всей вероятности, протекает по механизму катящегося кольца, причем сначала геном, представленный оцДНК, переводится в форму двуцепочечной ДНК. Для репликации представители Anelloviridae используют ДНК-полимеразу клетки-хозяина, поэтому репликация их геномов протекает в клеточном ядре[3].

Клиническое значение[править | править код]

Вирусы семейства Anelloviridae могут инфицировать человека. Инфицирование происходит в первые месяцы жизни, далее вирус размножается в ходе персистирующей инфекции. Бессимптомно ли заражение Anelloviridae, остаётся спорным вопросом. По всей видимости, размножение Anelloviridae в организме человека сдерживается иммунной системой, поскольку при иммуносупрессии титр вирусов семейства Anelloviridae увеличивается[10]. По оценкам, вирусами семейства Anelloviridae заражено более 90 % населения планеты на всех континентах[4]. Передача вирусов Anelloviridae возможна с каплями слюны, от матери к плоду и при половых контактах[4]. Также представители Anelloviridae поражают других позвоночных[11].

Классификация[править | править код]

В семейство Anelloviridae включают следующие роды вирусов, которые содержат около 200 видов[12]:

Примечания[править | править код]

  1. Таксономия вирусов (англ.) на сайте Международного комитета по таксономии вирусов (ICTV).
  2. Anelloviridae (англ.) // Virus Taxonomy. — 2012. — P. 331—341. — doi:10.1016/B978-0-12-384684-6.00033-1. [исправить]
  3. 1 2 3 4 Payne Susan. Other Small DNA Viruses (англ.) // Viruses. — 2017. — P. 243—246. — doi:10.1016/B978-0-12-803109-4.00030-1. [исправить]
  4. 1 2 3 4 Philippe Biagini. Virus Taxon. — Elsevier (London), 2011.
  5. Kaczorowska J., van der Hoek L. Human anelloviruses: diverse, omnipresent and commensal members of the virome. (англ.) // FEMS Microbiology Reviews. — 2020. — 1 May (vol. 44, no. 3). — P. 305—313. — doi:10.1093/femsre/fuaa007. — PMID 32188999. [исправить]
  6. Anelloviridae – ssDNA Viruses (2011) – ssDNA Viruses (2011) – ICTV. talk.ictvonline.org. Дата обращения: 20 ноября 2020. Архивировано 26 октября 2020 года.
  7. 1 2 Koonin E. V., Krupovic M., Agol V. I. The Baltimore Classification of Viruses 50 Years Later: How Does It Stand in the Light of Virus Evolution? (англ.) // Microbiology And Molecular Biology Reviews : MMBR. — 2021. — 18 August (vol. 85, no. 3). — P. e0005321—0005321. — doi:10.1128/MMBR.00053-21. — PMID 34259570. [исправить]
  8. Zheng H., Ye L., Fang X., Li B., Wang Y., Xiang X., Kong L., Wang W., Zeng Y., Ye L., Wu Z., She Y., Zhou X. Torque teno virus (SANBAN isolate) ORF2 protein suppresses NF-kappaB pathways via interaction with IkappaB kinases. (англ.) // Journal Of Virology. — 2007. — November (vol. 81, no. 21). — P. 11917—11924. — doi:10.1128/JVI.01101-07. — PMID 17686849. [исправить]
  9. Fermin Gustavo. Virion Structure, Genome Organization, and Taxonomy of Viruses (англ.) // Viruses. — 2018. — P. 17—54. — doi:10.1016/B978-0-12-811257-1.00002-4. [исправить]
  10. Freer G., Maggi F., Pifferi M., Di Cicco M. E., Peroni D. G., Pistello M. The Virome and Its Major Component, Anellovirus, a Convoluted System Molding Human Immune Defenses and Possibly Affecting the Development of Asthma and Respiratory Diseases in Childhood. (англ.) // Frontiers In Microbiology. — 2018. — Vol. 9. — P. 686—686. — doi:10.3389/fmicb.2018.00686. — PMID 29692764. [исправить]
  11. Bernardin F., Operskalski E., Busch M., Delwart E. Transfusion transmission of highly prevalent commensal human viruses. (англ.) // Transfusion. — 2010. — November (vol. 50, no. 11). — P. 2474—2483. — doi:10.1111/j.1537-2995.2010.02699.x. — PMID 20497515. [исправить]
  12. Virus Taxonomy: 2020 Release. International Committee on Taxonomy of Viruses (ICTV) (март 2021). Дата обращения: 23 мая 2021. Архивировано 20 марта 2020 года.