Ribozyviria

Из Википедии, бесплатной энциклопедии

Ribozyviria
Схема строения вириона вируса гепатита дельта
Схема строения вириона вируса гепатита дельта
Научная классификация
Группа:
Вирусы[1]
Реалм:
Ribozyviria
Международное научное название
Ribozyviria

Ribozyviria (лат.) — реалм[Ком. 1] РНК-содержащих вирусов, выделенный в 2020 году и по состоянию на 2020 год содержащий единственное семейство Kolmioviridae[2]. Представители Ribozyviria — вирусы-сателлиты, которые могут размножаться в заражённых клетках только в присутствии вируса-хозяина. Вирусы реалма Ribozyviria заражают только клетки животных, а наиболее изученным представителем реалма является патоген человека вирус гепатита дельта, который является сателлитом вируса гепатита B[3][4].

Описание[править | править код]

Представители реалма Ribozyviria, из которых по состоянию на 2022 год подробно изучен только вирус гепатита дельта, инфицируют только клетки животных. В геномах этих вирусов закодирован единственный белок, который подвергается посттрансляционным модификациям с образованием двух функционально различных форм белка, которые задействованы в размножении вируса и формируют нуклеокапсид внутри вирионов. По остальным свойствам вирусы из реалма Ribozyviria очень близки к вироидам и сателлитным РНК. Как и представители двух вышеупомянутых групп, вирусы из Ribozyviria реплицируются по механизму катящегося кольца, причём реакцию присоединения новых нуклеотидов катализирует ДНК-зависимая РНК-полимераза клетки-хозяина. Разрезание промежуточной длинной молекулы РНК на отдельные вирусные геномы осуществляет специальный рибозим, входящий в состав вируса. Представители Ribozyviria используют рибозимы нескольких типов, причём один из них уникален для вирусов реалма Ribozyviria[4].

Поскольку члены Ribozyviria устроены гораздо сложнее, чем вироиды и другие вироидоподобные агенты, и имеют единственный структурный ген, предполагается, что Ribozyviria произошли от вироидов. Однако вироиды являются патогенами растений, поэтому возникновению Ribozyviria, вероятно, предшествовал горизонтальный перенос этих агентов от растений к животным. Предполагается, что в ходе эволюции члены Ribozyviria приобрели белок-кодирующий ген в ходе рекомбинации с генетическим материалом животной клетки[4].

Классификация[править | править код]

По состоянию на 2020 год реалм Ribozyviria содержит единственное семейство, Kolmioviridae, содержащее восемь родов. Таксоны промежуточного ранга между семейством и родом не выделены. Названия всех родов, входящих в состав Kolmioviridae, в своем названии содержат название буквы D на разных языках. Название самого семейства происходит от сунд. kolmio — треугольник, поскольку буква Δ греческого алфавита, соответствующая латинской D, имеет треугольное начертание[3].

Ниже приведена таксономия реалма Ribozyviria по состоянию на 2020 год:[2]

  • Реалм: Ribozyviria
    • Семейство: Kolmioviridae
      • Род: Daazvirus[en]
      • Род: Dagazvirus[en]
      • Род: Daletvirus[en]
      • Род: Dalvirus[en]
      • Род: Deevirus[en]
        • Вид: Deevirus actinopterygii [также известен как RFFV-1 (от англ. ray-finned fish virus 1), ранее fHDV] (хозяин: различные лучепёрые рыбы)[5]
      • Род: Deltavirus[2]
        • Вид: Deltavirus cameroonense [вирус гепатита дельта человека 7 (HDV-7)] (хозяин: Homo sapiens)
        • Вид: Deltavirus carense [вирус гепатита дельта человека 6 (HDV-6)] (хозяин: H. sapiens)
        • Вид: Deltavirus italiense [вирус гепатита дельта человека 1 (HDV-1)] (хозяин: H. sapiens)
        • Вид: Deltavirus japanense [вирус гепатита дельта человека 2 (HDV-2)] (хозяин: H. sapiens)
        • Вид: Deltavirus peruense [вирус гепатита дельта человека 3 (HDV-3)] (хозяин: H. sapiens)
        • Вид: Deltavirus senegalense [вирус гепатита дельта человека 8 (HDV-8)] (хозяин: H. sapiens)
        • Вид: Deltavirus taiwanense [вирус гепатита дельта человека 4 (HDV-4)] (хозяин: H. sapiens)
        • Вид: Deltavirus togense [вирус гепатита дельта человека 5 (HDV-5)] (хозяин: H. sapiens)
      • Род: Dobrovirus[en]
      • Род: Thurisazvirus[en]

История изучения[править | править код]

Первый известный представитель реалма Ribozyviria, вирус гепатита дельта (вид Hepatitis delta virus, род Deltavirus), был открыт в 1993 году. С тех пор несколько членов Ribozyviria, заражающих клетки разных видов животных, были описаны с помощью метагеномики[4]. До 2018 года таксономическое положение рода Deltavirus оставалось неопределённым, пока Международный комитет по таксономии вирусов (ICTV) не отнёс его ошибочно в новообразованный реалм Riboviria. В 2019 году ошибка была исправлена, и таксономическое положение Deltavirus вновь стало неопределённым. В 2020 году вид Hepatitis delta virus расформирован, вместо него было выделено восемь новых видов, отнесённых к реалму Ribozyviria.

Примечания[править | править код]

Комментарии

  1. ↑ На данный момент устоявшегося русскоязычного термина, соответствующего англ. realm в таксономии, нет.

Источники

  1. ↑ Таксономия вирусов (англ.) на сайте Международного комитета по таксономии вирусов (ICTV).
  2. ↑ 1 2 3 Таксономия вирусов (англ.) на сайте Международного комитета по таксономии вирусов (ICTV). (Дата обращения: 27 апреля 2020).
  3. ↑ 1 2 Create one new realm (Ribozyviria) including one new family (Kolmioviridae) including genus Deltavirus and seven new genera for a total of 15 species (англ.) (docx). International Committee on Taxonomy of Viruses (ICTV) (6 декабря 2020). Дата обращения: 27 мая 2021. Архивировано 16 мая 2021 года.
  4. ↑ 1 2 3 4 Lee Benjamin D., Koonin Eugene V. Viroids and Viroid-like Circular RNAs: Do They Descend from Primordial Replicators? (англ.) // Life. — 2022. — 12 January (vol. 12, no. 1). — P. 103. — ISSN 2075-1729. — doi:10.3390/life12010103. [исправить]
  5. ↑ 1 2 3 4 Chang W. S., Pettersson J. H., Le Lay C., Shi M., Lo N., Wille M., Eden J. S., Holmes E. C. Novel hepatitis D-like agents in vertebrates and invertebrates. (англ.) // Virus Evolution. — 2019. — July (vol. 5, no. 2). — P. 021—021. — doi:10.1093/ve/vez021. — PMID 31321078. [исправить]
  6. ↑ Hetzel U., Szirovicza L., Smura T., Prähauser B., Vapalahti O., Kipar A., Hepojoki J. Identification of a Novel Deltavirus in Boa Constrictors. (англ.) // MBio. — 2019. — 2 April (vol. 10, no. 2). — doi:10.1128/mBio.00014-19. — PMID 30940697. [исправить]
  7. ↑ Wille M., Netter H. J., Littlejohn M., Yuen L., Shi M., Eden J. S., Klaassen M., Holmes E. C., Hurt A. C. A Divergent Hepatitis D-Like Agent in Birds. (англ.) // Viruses. — 2018. — 17 December (vol. 10, no. 12). — doi:10.3390/v10120720. — PMID 30562970. [исправить]
  8. ↑ Paraskevopoulou S., Pirzer F., Goldmann N., Schmid J., Corman V. M., Gottula L. T., Schroeder S., Rasche A., Muth D., Drexler J. F., Heni A. C., Eibner G. J., Page R. A., Jones T. C., Müller M. A., Sommer S., Glebe D., Drosten C. Mammalian deltavirus without hepadnavirus coinfection in the neotropical rodent Proechimys semispinosus. (англ.) // Proceedings Of The National Academy Of Sciences Of The United States Of America. — 2020. — 28 July (vol. 117, no. 30). — P. 17977—17983. — doi:10.1073/pnas.2006750117. — PMID 32651267. [исправить]
Источник — https://ru.wikipedia.org/w/index.php?title=Ribozyviria&oldid=133028859