OPN1LW

OPN1LW
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	1KPX
Ідентифікатори
Символи	OPN1LW, CBBM, CBP, COD5, RCP, ROP, opsin 1 (cone pigments), long-wave-sensitive, opsin 1, long wave sensitive
Зовнішні ІД	OMIM: 300822 MGI: 1097692 HomoloGene: 68064 GeneCards: OPN1LW
Пов'язані генетичні захворювання
	blue cone monochromacy
Онтологія гена
Молекулярна функція	• G protein-coupled receptor activity; • photoreceptor activity; • signal transducer activity; • G protein-coupled photoreceptor activity;
Клітинна компонента	• integral component of membrane; • integral component of plasma membrane; • мембрана; • photoreceptor outer segment; • photoreceptor disc membrane;
Біологічний процес	• positive regulation of cytokinesis; • GO:0072468 сигнальна трансдукція; • зір; • retinoid metabolic process; • відповідь на стимул; • phototransduction; • detection of visible light; • G protein-coupled receptor signaling pathway; • cellular response to light stimulus;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	Більше даних
Ортологи
	5956
	14539
	ENSG00000102076
	ENSMUSG00000031394
	P04000
	O35599
	NM_020061
	NM_008106
	NP_064445
	NP_032132
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

OPN1LW (англ. Opsin 1 (cone pigments), medium-wave-sensitive (color blindness, deutan)) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на X-хромосомі.^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 359 амінокислот, а молекулярна маса — 40 218^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MAQRLTGEQT	LDHYEDSTHA	SIFTYTNSNS	TKGPFEGPNY	HIAPRWVYHL
TSTWMILVVV	ASVFTNGLVL	AATMRFKKLR	HPLNWILVNL	AVADLAETII
ASTISVVNQI	YGYFVLGHPL	CVIEGYIVSL	CGITGLWSLA	IISWERWLVV
CKPFGNVRFD	AKLATVGIVF	SWVWAAIWTA	PPIFGWSRYW	PYGLKTSCGP
DVFSGTSYPG	VQSYMMVLMV	TCCIFPLSII	VLCYLQVWLA	IRAVAKQQKE
SESTQKAEKE	VTRMVVVMVF	AYCLCWGPYT	FFACFATAHP	GYAFHPLVAS
LPSYFAKSAT	IYNPIIYVFM	NRQFRNCILH	LFGKKVDDSS	ELSSTSKTEV
SSVSSVSPA

A: Аланін
 C: Цистеїн
 D: Аспарагінова кислота
 E: Глутамінова кислота
 F: Фенілаланін
 G: Гліцин
 H: Гістидин
 I: Ізолейцин
 K: Лізин
 L: Лейцин
 M: Метіонін
 N: Аспарагін
 P: Пролін
 Q: Глутамін
 R: Аргінін
 S: Серин
 T: Треонін
 V: Валін
 W: Триптофан
 
 Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до рецепторів, g-білокспряжених рецепторів, білків внутрішньоклітинного сигналінгу, фосфопротеїнів. Білок має сайт для зв'язування з хромофором. Локалізований у мембрані.

Література

Sun H., Macke J.P., Nathans J. (1997). Mechanisms of spectral tuning in the mouse green cone pigment. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 94: 8860—8865. PMID 9238068 DOI:10.1073/pnas.94.16.8860
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504