CLEC9A

CLEC9A
Доступные структуры
PDBПоиск ортологов: PDBe RCSB
Список идентификаторов PDB

3VPP

Идентификаторы
ПсевдонимыCLEC9A, DNGR1, UNQ9341, CD370, DNGR-1, C-type lectin domain family 9 member A, C-type lectin domain containing 9A
Внешние IDOMIM: 612252 MGI: 2444608 HomoloGene: 52106 GeneCards: CLEC9A
Расположение гена (человек)
12-я хромосома человека
Хр.12-я хромосома человека[1]
12-я хромосома человека
Расположение в геноме CLEC9A
Расположение в геноме CLEC9A
Локус12p13.2Начало10,030,678 bp[1]
Конец10,066,031 bp[1]
Расположение гена (Мышь)
6-я хромосома мыши
Хр.6-я хромосома мыши[2]
6-я хромосома мыши
Расположение в геноме CLEC9A
Расположение в геноме CLEC9A
Локус6|6 F3Начало129,385,825 bp[2]
Конец129,401,726 bp[2]
Паттерн экспрессии РНК
Bgee
ЧеловекМышь (ортолог)
Наибольшая экспрессия в
Дополнительные справочные данные
BioGPS
н/д
Генная онтология
Молекулярная функция
Компонент клетки
Биологический процесс
Источники: Amigo, QuickGO
Ортологи
ВидЧеловекМышь
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (мРНК)

NM_207345

NM_001205363
NM_001205364
NM_001205365
NM_172732

RefSeq (белок)

NP_997228

NP_001192292
NP_001192293
NP_001192294
NP_766320

Локус (UCSC)Chr 12: 10.03 – 10.07 MbChr 6: 129.39 – 129.4 Mb
Поиск по PubMedИскать[3]Искать[4]
Логотип Викиданных Информация в Викиданных
Смотреть (человек)Смотреть (мышь)

CLEC9A (англ. C-type lectin domain family 9 member A, лектин С-типа домен семейство 9 член A; CD370) — мембранный белок, экспрессирован на подтипе дендритных клеток и моноцитов. Продукт гена человека CLEC9A[5].

Является мембранным белком класса лектинов типа С, входит в группу V. Экспрессирован на миелоидных клетках. Функционирует как рецептор эндоцитоза на небольшом подтипе миелоидных клеток, специализирующихся в захвате и процессировании материала мёртвых клеток. Распознаёт филаментную форму актина, ассоциированного с актин-связывающими доменами цитоскелетных белков, включая спектрин, экспонированного во внеклеточную среду в случае повреждения клеток. Опосредует SYK-зависимую перекрёстную презентацию антигенов, ассоциированных с мёртвыми клетками.

CLEC9A состоит из 241 аминокислоты, молекулярная масса 27,3 кДа. Содержит лектиновый домен типа C и активирующий ITAM-подобный мотив.

Тканевая специфичность

[править | править код]

Белок экспрессирован в периферической крови на поверхности BDCA31+ дендритных клеток и на подтипе CD14+/CD16- моноцитов.

Примечания

[править | править код]
  1. 1 2 3 GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000197992 - Ensembl, May 2017
  2. 1 2 3 GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000046080 - Ensembl, May 2017
  3. Ссылка на публикацию человека на PubMed: Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  4. Ссылка на публикацию мыши на PubMed: Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  5. Entrez Gene: C-type lectin domain family 9 member A (англ.). Дата обращения: 2 июня 2016. Архивировано 22 ноября 2018 года.

Литература

[править | править код]
  • Huysamen C., Willment J.A., Dennehy K.M., Brown G.D. CLEC9A is a novel activation C-type lectin-like receptor expressed on BDCA3+ dendritic cells and a subset of monocytes (англ.) // J. Biol. Chem. : journal. — 2008. — Vol. 283, no. 24. — P. 16693—16701. — doi:10.1074/jbc.M709923200. — PMID 18408006. — PMC 2562446.