EMR2

EMR2
EMR2
Доступные структуры
Доступные структуры
PDB	Поиск по базе UniProt: PDBe RCSB
Список идентификаторов PDB
Список идентификаторов PDB
	2BOX, 2BO2, 2BOU
Идентификаторы
Псевдонимы	ADGRE2, CD312, VBU, EMR2, adhesion G protein-coupled receptor E2, CD97
Внешние ID	OMIM: 606100 HomoloGene: 113735 GeneCards: ADGRE2
Расположение гена (человек)
Расположение гена (человек)
Хр.	19-я хромосома человека
Конец	14,778,560 bp
Паттерн экспрессии РНК
Паттерн экспрессии РНК
	Наибольшая экспрессия в
	upper lobe of left lung;
	н/д
	Дополнительные справочные данные
	Дополнительные справочные данные
Генная онтология
Генная онтология
Молекулярная функция	calcium ion binding; chondroitin sulfate binding; transmembrane signaling receptor activity; signal transducer activity; G protein-coupled receptor activity;
Компонент клетки	ruffle membrane; клеточная мембрана; cell projection; мембрана; leading edge membrane; часть мембраны; внутренний компонент клетки; часть клеточной мембраны;
Биологический процесс	cell surface receptor signaling pathway; воспалительная реакция; миграция клеток; granulocyte chemotaxis; передача сигнала; G protein-coupled receptor signaling pathway; агрегация клеток; regulation of mast cell degranulation; adenylate cyclase-activating G protein-coupled receptor signaling pathway;
	Источники: Amigo, QuickGO
Ортологи
Ортологи
	30817
	н/д
	ENSG00000127507
	н/д
	Q9UHX3
	н/д
NM_001271052; NM_013447; NM_152916; NM_152917; NM_152918;
	NM_152919; NM_152920; NM_152921
	н/д
	NP_001257981; NP_038475
	н/д
	Информация в Викиданных
Смотреть (человек)

EMR2 (англ. EGF-like module-containing mucin-like hormone receptor-like 2; CD312) — мембранный белок группы адгезивных рецепторов, сопряжённых с G-белком^[3]^[4]. Продукт гена человека ADGRE2^[5]. Белки этой группы характеризуются относительно большим внеклеточным участком с особым аутопротеолитическим участком^[6]. EMR2 экспрессирован на моноцитах и макрофагах, на дендритных клетках и всех типах гранулоцитов^[7] Альтернативный сплайсинг приводит к полиморфизму EMR2, который в результате содержит от 2 до 5 EGF-подобных доменов на N-концевом участке белка. Эти домены у EMR2 на 97% идентичны с таковыми белка CD97^[8]. Аналог гена Emr2 отсутствует в геноме мыши.^[9] Ген также тесно связан с геном EMR3 на хромосоме 19.

Лиганд

EMR2, так же как белок CD97, связывает хондроитинсульфат B и таким образом играет роль в прикреплении клетки^[10].

Примечания

↑ ¹ ² ³ GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000127507 - Ensembl, May 2017
↑ Ссылка на публикацию человека на PubMed: (неопр.) Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
↑ Stacey M., Yona S. Adhesion-GPCRs: Structure to Function (Advances in Experimental Medicine and Biology) (англ.). — Berlin: Springer, 2011. — ISBN 1-4419-7912-3.
↑ Langenhan T., Aust G., Hamann J. Sticky signaling--adhesion class G protein-coupled receptors take the stage (англ.) // Science Signaling^[англ.] : journal. — 2013. — May (vol. 6, no. 276). — P. re3. — doi:10.1126/scisignal.2003825. — PMID 23695165.
↑ Hamann J., Aust G., Araç D., Engel F.B., Formstone C., Fredriksson R., Hall R.A., Harty B.L., Kirchhoff C., Knapp B., Krishnan A., Liebscher I., Lin H.H., Martinelli D.C., Monk K.R., Peeters M.C., Piao X., Prömel S., Schöneberg T., Schwartz T.W., Singer K., Stacey M., Ushkaryov Y.A., Vallon M., Wolfrum U., Wright M.W., Xu L., Langenhan T., Schiöth H.B. International Union of Basic and Clinical Pharmacology. XCIV. Adhesion G protein-coupled receptors (англ.) // Pharmacological Reviews^[англ.] : journal. — 2015. — April (vol. 67, no. 2). — P. 338—367. — doi:10.1124/pr.114.009647. — PMID 25713288. — PMC 4394687.
↑ Araç D., Boucard A.A., Bolliger M.F., Nguyen J., Soltis S.M., Südhof T.C., Brunger A.T. A novel evolutionarily conserved domain of cell-adhesion GPCRs mediates autoproteolysis (англ.) // The EMBO Journal : journal. — 2012. — March (vol. 31, no. 6). — P. 1364—1378. — doi:10.1038/emboj.2012.26. — PMID 22333914. — PMC 3321182.
↑ Lin H.H., Stacey M., Hamann J., Gordon S., McKnight A.J. Human EMR2, a novel EGF-TM7 molecule on chromosome 19p13.1, is closely related to CD97 (англ.) // Genomics : journal. — Academic Press, 2000. — July (vol. 67, no. 2). — P. 188—200. — doi:10.1006/geno.2000.6238. — PMID 10903844.
↑ Gordon S., Hamann J., Lin H.H., Stacey M. F4/80 and the related adhesion-GPCRs (англ.) // European Journal of Immunology^[англ.] : journal. — 2011. — September (vol. 41, no. 9). — P. 2472—2476. — doi:10.1002/eji.201141715. — PMID 21952799.
↑ Kwakkenbos M.J., Matmati M., Madsen O., Pouwels W., Wang Y., Bontrop R.E., Heidt P.J., Hoek R.M., Hamann J. An unusual mode of concerted evolution of the EGF-TM7 receptor chimera EMR2 (англ.) // The FASEB Journal^[англ.] : journal. — Federation of American Societies for Experimental Biology^[англ.], 2006. — December (vol. 20, no. 14). — P. 2582—2584. — doi:10.1096/fj.06-6500fje. — PMID 17068111.
↑ Stacey M., Chang G.W., Davies J.Q., Kwakkenbos M.J., Sanderson R.D., Hamann J., Gordon S., Lin H.H. The epidermal growth factor-like domains of the human EMR2 receptor mediate cell attachment through chondroitin sulfate glycosaminoglycans (англ.) // Blood : journal. — American Society of Hematology^[англ.], 2003. — October (vol. 102, no. 8). — P. 2916—2924. — doi:10.1182/blood-2002-11-3540. — PMID 12829604.

[refGRCh38EnsemblENSG00000127507-1] ¹ ² ³ GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000127507 - Ensembl, May 2017

[2] Ссылка на публикацию человека на PubMed: (неопр.) Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.

[isbn1-4419-7912-3-3] Stacey M., Yona S. Adhesion-GPCRs: Structure to Function (Advances in Experimental Medicine and Biology) (англ.). — Berlin: Springer, 2011. — ISBN 1-4419-7912-3.

[4] Langenhan T., Aust G., Hamann J. Sticky signaling--adhesion class G protein-coupled receptors take the stage (англ.) // Science Signaling^[англ.] : journal. — 2013. — May (vol. 6, no. 276). — P. re3. — doi:10.1126/scisignal.2003825. — PMID 23695165.

[5] Hamann J., Aust G., Araç D., Engel F.B., Formstone C., Fredriksson R., Hall R.A., Harty B.L., Kirchhoff C., Knapp B., Krishnan A., Liebscher I., Lin H.H., Martinelli D.C., Monk K.R., Peeters M.C., Piao X., Prömel S., Schöneberg T., Schwartz T.W., Singer K., Stacey M., Ushkaryov Y.A., Vallon M., Wolfrum U., Wright M.W., Xu L., Langenhan T., Schiöth H.B. International Union of Basic and Clinical Pharmacology. XCIV. Adhesion G protein-coupled receptors (англ.) // Pharmacological Reviews^[англ.] : journal. — 2015. — April (vol. 67, no. 2). — P. 338—367. — doi:10.1124/pr.114.009647. — PMID 25713288. — PMC 4394687.

[pmid22333914-6] Araç D., Boucard A.A., Bolliger M.F., Nguyen J., Soltis S.M., Südhof T.C., Brunger A.T. A novel evolutionarily conserved domain of cell-adhesion GPCRs mediates autoproteolysis (англ.) // The EMBO Journal : journal. — 2012. — March (vol. 31, no. 6). — P. 1364—1378. — doi:10.1038/emboj.2012.26. — PMID 22333914. — PMC 3321182.

[7] Lin H.H., Stacey M., Hamann J., Gordon S., McKnight A.J. Human EMR2, a novel EGF-TM7 molecule on chromosome 19p13.1, is closely related to CD97 (англ.) // Genomics : journal. — Academic Press, 2000. — July (vol. 67, no. 2). — P. 188—200. — doi:10.1006/geno.2000.6238. — PMID 10903844.

[8] Gordon S., Hamann J., Lin H.H., Stacey M. F4/80 and the related adhesion-GPCRs (англ.) // European Journal of Immunology^[англ.] : journal. — 2011. — September (vol. 41, no. 9). — P. 2472—2476. — doi:10.1002/eji.201141715. — PMID 21952799.

[9] Kwakkenbos M.J., Matmati M., Madsen O., Pouwels W., Wang Y., Bontrop R.E., Heidt P.J., Hoek R.M., Hamann J. An unusual mode of concerted evolution of the EGF-TM7 receptor chimera EMR2 (англ.) // The FASEB Journal^[англ.] : journal. — Federation of American Societies for Experimental Biology^[англ.], 2006. — December (vol. 20, no. 14). — P. 2582—2584. — doi:10.1096/fj.06-6500fje. — PMID 17068111.

[10] Stacey M., Chang G.W., Davies J.Q., Kwakkenbos M.J., Sanderson R.D., Hamann J., Gordon S., Lin H.H. The epidermal growth factor-like domains of the human EMR2 receptor mediate cell attachment through chondroitin sulfate glycosaminoglycans (англ.) // Blood : journal. — American Society of Hematology^[англ.], 2003. — October (vol. 102, no. 8). — P. 2916—2924. — doi:10.1182/blood-2002-11-3540. — PMID 12829604.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]

Белки: Кластеры дифференцировки
1-50	CD1 (a-c, 1A, 1D, 1E) CD2 CD3 (γ, δ, ε) CD4 CD5 CD6 CD7 CD8 (a) CD9 CD10 CD11 (a, b, c, d) CD13 CD14 CD15 CD16 (A, B) CD18 CD19 CD20 CD21 CD22 CD23 CD24 CD25 CD26 CD27 CD28 CD29 CD30 CD31 CD32 (A, B) CD33 CD34 CD35 CD36 CD37 CD38 CD39 CD40 CD41 CD42 (a, b, c, d) CD43 CD44 CD45 CD46 CD47 CD48 CD49 (a, b, c, d, e, f) CD50
51-100	CD51 CD52 CD53 CD54 CD55 CD56 CD57 CD58 CD59 CD61 CD62 (E, L, P) CD63 CD64 (A, B, C) CD66 (a, b, c, d, e, f) CD68 CD69 CD70 CD71 CD72 CD73 CD74 CD78 CD79 (a, b) CD80 CD81 CD82 CD83 CD84 CD85 (a, d, e, h, j, k) CD86 CD87 CD88 CD89 CD90 CD91 CD92 CD93 CD94 CD95 CD96 CD97 CD98 CD99 CD100
101-150	CD101 CD102 CD103 CD104 CD105 CD106 CD107 (a, b) CD108 CD109 CD110 CD111 CD112 CD113 CD114 CD115 CD116 CD117 CD118 CD119 CD120 (a, b) CD121 (a, b) CD122 CD123 CD124 CD125 CD126 CD127 CD129 CD130 CD131 CD132 CD133 CD134 CD135 CD136 CD137 CD138 CD140b CD141 CD142 CD143 CD144 CD146 CD147 CD148 CD150
151-200	CD151 CD152 CD153 CD154 CD155 CD156 (a, b, c) CD157 CD158 (a, d, e, i, k) CD159 (a, c) CD160 CD161 CD162 CD163 CD164 CD166 CD167 (a, b) CD168 CD169 CD170 CD171 CD172 (a, b, g) CD174 CD177 CD178 CD179 (a, b) CD181 CD182 CD183 CD184 CD185 CD186 CD191 CD192 CD193 CD194 CD195 CD196 CD197 CDw198 CDw199 CD200
201-250	CD201 CD202b CD204 CD205 CD206 CD207 CD208 CD209 CDw210 (a, b) CD212 CD213a (1, 2) CD217 CD218 (a, b) CD220 CD221 CD222 CD223 CD224 CD225 CD226 CD227 CD228 CD229 CD230 CD233 CD234 CD235 (a, b) CD236 CD238 CD239 CD240CE CD240D CD241 CD243 CD244 CD246 CD247 CD248 CD249
251-300	CD252 CD253 CD254 CD256 CD257 CD258 CD261 CD262 CD263 CD264 CD265 CD266 CD267 CD268 CD269 CD270 CD271 CD272 CD273 CD274 CD275 CD276 CD278 CD279 CD280 CD281 CD282 CD283 CD284 CD286 CD288 CD289 CD290 CD292 CDw293 CD294 CD295 CD297 CD298 CD299
301-350	CD300A CD301 CD302 CD303 CD304 CD305 CD306 CD307 CD309 CD312 CD314 CD315 CD316 CD317 CD318 CD319 CD320 CD321 CD322 CD324 CD325 CD326 CD328 CD329 CD331 CD332 CD333 CD334 CD335 CD336 CD337 CD338 CD339 CD340 CD344 CD349 CD350
351-400	CD351 CD352 CD353 CD354 CD355 CD357 CD358 CD360 CD361 CD362 CD363 CD364 CD365 CD366 CD367 CD368 CD369 CD370 CD371

EMR2

Лиганд

Примечания

€4.95