FCRL5

FCRL5
FCRL5
Идентификаторы
Псевдонимы	FCRL5, BXMAS1, CD307, CD307e, FCRH5, IRTA2, PRO820, Fc receptor like 5
Внешние ID	OMIM: 605877 MGI: 3053558 HomoloGene: 137404 GeneCards: FCRL5
Расположение гена (человек)
Расположение гена (человек)
Хр.	1-я хромосома человека
Конец	157,552,515 bp
Расположение гена (Мышь)
Расположение гена (Мышь)
Хр.	3-я хромосома мыши
Конец	87,407,985 bp
Паттерн экспрессии РНК
Паттерн экспрессии РНК
	Наибольшая экспрессия в
	mucosa of ileum; ; buccal mucosa cell; ; epithelium of nasopharynx;
	н/д
	Дополнительные справочные данные
	н/д
Ортологи
Ортологи
	83416
	329693
	ENSG00000143297
	ENSMUSG00000048031
	Q96RD9
	Q68SN8
	NM_001195388; NM_031281
	NM_001113238; NM_183222
	NP_001182317; NP_112571
	NP_001106709; NP_899045
	Информация в Викиданных
Смотреть (человек)	Смотреть (мышь)

FCRL5 (англ. Fc receptor-like protein 5, Fc-рецептор-подобный белок, тип 5; CD307) — мембранный белок. Продукт гена человека FCRL5^[5]^[6]^[7].

Функции

FCRL5 участвует в клеточной дифференцировке В-лимфоцитов, иммунном ответе и, возможно, в развитии В-клеточных опухолей.

Структура

Белок FCRL5 состоит из 977 аминокислот, содержит один трансмембранный домен. Молекулярная масса 100 кДа. Внеклеточный участок содержит 1 участок гликозилирования и 8 дисульфидных связей.

Тканевая локализция

Белок экспрессирован на B-клетках маргинальной зоны, иммунобластах, центроцитах герминального центра миндалин и во внутриэпителиальных и межфолликулярных зонах миндалин. Выявляется на многих клетках лимфомы. Изоформы 1, 3, 4 и 5 обнаруживается в лимфатических узлах, селезёнке, костном мозге и тонком кишечнике, причём превалирует 3-я изоформа. Экспрессирован на зрелых В-клетках и на В-клетках памяти.

Примечания

↑ ¹ ² ³ GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000143297 - Ensembl, May 2017
↑ ¹ ² ³ GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000048031 - Ensembl, May 2017
↑ Ссылка на публикацию человека на PubMed: (неопр.) Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
↑ Ссылка на публикацию мыши на PubMed: (неопр.) Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
↑ Nakayama Y., Iwamoto Y., Maher S.E., Tanaka Y., Bothwell A.L. Altered gene expression upon BCR cross-linking in Burkitt's lymphoma B cell line (англ.) // Biochem Biophys Res Commun^[англ.] : journal. — 2000. — December (vol. 277, no. 1). — P. 124—127. — doi:10.1006/bbrc.2000.3639. — PMID 11027651.
↑ Hatzivassiliou G., Miller I., Takizawa J., Palanisamy N., Rao P.H., Iida S., Tagawa S., Taniwaki M., Russo J., Neri A., Cattoretti G., Clynes R., Mendelsohn C., Chaganti R.S., Dalla-Favera R. IRTA1 and IRTA2, novel immunoglobulin superfamily receptors expressed in B cells and involved in chromosome 1q21 abnormalities in B cell malignancy (англ.) // Immunity : journal. — Cell Press, 2001. — April (vol. 14, no. 3). — P. 277—289. — doi:10.1016/S1074-7613(01)00109-1. — PMID 11290337.
↑ Entrez Gene: FCRL5 Fc receptor-like 5 (неопр.).

Литература

Nakayama Y., Weissman S.M., Bothwell A.L. BXMAS1 identifies a cluster of homologous genes differentially expressed in B cells. (англ.) // Biochem. Biophys. Res. Commun.^[англ.] : journal. — 2001. — Vol. 285, no. 3. — P. 830—837. — doi:10.1006/bbrc.2001.5231. — PMID 11453668.
Davis R.S., Wang Y.H., Kubagawa H., Cooper M.D. Identification of a family of Fc receptor homologs with preferential B cell expression (англ.) // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : journal. — 2001. — Vol. 98, no. 17. — P. 9772—9777. — doi:10.1073/pnas.171308498. — PMID 11493702. — PMC 55528.
Miller I., Hatzivassiliou G., Cattoretti G. et al. IRTAs: a new family of immunoglobulinlike receptors differentially expressed in B cells (англ.) // Blood : journal. — American Society of Hematology^[англ.], 2002. — Vol. 99, no. 8. — P. 2662—2669. — doi:10.1182/blood.V99.8.2662. — PMID 11929751.
Strausberg R.L., Feingold E.A., Grouse L.H. et al. Generation and initial analysis of more than 15,000 full-length human and mouse cDNA sequences (англ.) // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : journal. — 2003. — Vol. 99, no. 26. — P. 16899—16903. — doi:10.1073/pnas.242603899. — PMID 12477932. — PMC 139241.
Clark H.F., Gurney A.L., Abaya E. et al. The Secreted Protein Discovery Initiative (SPDI), a Large-Scale Effort to Identify Novel Human Secreted and Transmembrane Proteins: A Bioinformatics Assessment (англ.) // Genome Res. : journal. — 2003. — Vol. 13, no. 10. — P. 2265—2270. — doi:10.1101/gr.1293003. — PMID 12975309. — PMC 403697.
Gerhard D.S., Wagner L., Feingold E.A. et al. The Status, Quality, and Expansion of the NIH Full-Length cDNA Project: The Mammalian Gene Collection (MGC) (англ.) // Genome Res. : journal. — 2004. — Vol. 14, no. 10B. — P. 2121—2127. — doi:10.1101/gr.2596504. — PMID 15489334. — PMC 528928.
Ise T., Maeda H., Santora K. et al. Immunoglobulin superfamily receptor translocation associated 2 protein on lymphoma cell lines and hairy cell leukemia cells detected by novel monoclonal antibodies (англ.) // Clin. Cancer Res.^[англ.] : journal. — 2005. — Vol. 11, no. 1. — P. 87—96. — PMID 15671532.
Mohan J., Dement-Brown J., Maier S. et al. Epstein-Barr virus nuclear antigen 2 induces FcRH5 expression through CBF1 (англ.) // Blood : journal. — American Society of Hematology^[англ.], 2006. — Vol. 107, no. 11. — P. 4433—4439. — doi:10.1182/blood-2005-09-3815. — PMID 16439682.
Ise T., Kreitman R.J., Pastan I., Nagata S. Sandwich ELISAs for soluble immunoglobulin superfamily receptor translocation-associated 2 (IRTA2)/FcRH5 (CD307) proteins in human sera (англ.) // Clin. Chem. Lab. Med.^[англ.] : journal. — 2006. — Vol. 44, no. 5. — P. 594—602. — doi:10.1515/CCLM.2006.115. — PMID 16681430.
Gregory S.G., Barlow K.F., McLay K.E. et al. The DNA sequence and biological annotation of human chromosome 1 (англ.) // Nature : journal. — 2006. — Vol. 441, no. 7091. — P. 315—321. — doi:10.1038/nature04727. — PMID 16710414.
Taylor A.I., Gould H.J., Sutton B.J., Calvert R.A. The first avian Ig-like Fc receptor family member combines features of mammalian FcR and FCRL (англ.) // Immunogenetics : journal. — 2007. — Vol. 59, no. 4. — P. 323—328. — doi:10.1007/s00251-007-0195-9. — PMID 17273841.

[refGRCh38EnsemblENSG00000143297-1] ¹ ² ³ GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000143297 - Ensembl, May 2017

[refGRCm38EnsemblENSMUSG00000048031-2] ¹ ² ³ GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000048031 - Ensembl, May 2017

[3] Ссылка на публикацию человека на PubMed: (неопр.) Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.

[4] Ссылка на публикацию мыши на PubMed: (неопр.) Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.

[pmid11027651-5] Nakayama Y., Iwamoto Y., Maher S.E., Tanaka Y., Bothwell A.L. Altered gene expression upon BCR cross-linking in Burkitt's lymphoma B cell line (англ.) // Biochem Biophys Res Commun^[англ.] : journal. — 2000. — December (vol. 277, no. 1). — P. 124—127. — doi:10.1006/bbrc.2000.3639. — PMID 11027651.

[pmid11290337-6] Hatzivassiliou G., Miller I., Takizawa J., Palanisamy N., Rao P.H., Iida S., Tagawa S., Taniwaki M., Russo J., Neri A., Cattoretti G., Clynes R., Mendelsohn C., Chaganti R.S., Dalla-Favera R. IRTA1 and IRTA2, novel immunoglobulin superfamily receptors expressed in B cells and involved in chromosome 1q21 abnormalities in B cell malignancy (англ.) // Immunity : journal. — Cell Press, 2001. — April (vol. 14, no. 3). — P. 277—289. — doi:10.1016/S1074-7613(01)00109-1. — PMID 11290337.

[entrez-7] Entrez Gene: FCRL5 Fc receptor-like 5 (неопр.).

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

Белки: Кластеры дифференцировки
1-50	CD1 (a-c, 1A, 1D, 1E) CD2 CD3 (γ, δ, ε) CD4 CD5 CD6 CD7 CD8 (a) CD9 CD10 CD11 (a, b, c, d) CD13 CD14 CD15 CD16 (A, B) CD18 CD19 CD20 CD21 CD22 CD23 CD24 CD25 CD26 CD27 CD28 CD29 CD30 CD31 CD32 (A, B) CD33 CD34 CD35 CD36 CD37 CD38 CD39 CD40 CD41 CD42 (a, b, c, d) CD43 CD44 CD45 CD46 CD47 CD48 CD49 (a, b, c, d, e, f) CD50
51-100	CD51 CD52 CD53 CD54 CD55 CD56 CD57 CD58 CD59 CD61 CD62 (E, L, P) CD63 CD64 (A, B, C) CD66 (a, b, c, d, e, f) CD68 CD69 CD70 CD71 CD72 CD73 CD74 CD78 CD79 (a, b) CD80 CD81 CD82 CD83 CD84 CD85 (a, d, e, h, j, k) CD86 CD87 CD88 CD89 CD90 CD91 CD92 CD93 CD94 CD95 CD96 CD97 CD98 CD99 CD100
101-150	CD101 CD102 CD103 CD104 CD105 CD106 CD107 (a, b) CD108 CD109 CD110 CD111 CD112 CD113 CD114 CD115 CD116 CD117 CD118 CD119 CD120 (a, b) CD121 (a, b) CD122 CD123 CD124 CD125 CD126 CD127 CD129 CD130 CD131 CD132 CD133 CD134 CD135 CD136 CD137 CD138 CD140b CD141 CD142 CD143 CD144 CD146 CD147 CD148 CD150
151-200	CD151 CD152 CD153 CD154 CD155 CD156 (a, b, c) CD157 CD158 (a, d, e, i, k) CD159 (a, c) CD160 CD161 CD162 CD163 CD164 CD166 CD167 (a, b) CD168 CD169 CD170 CD171 CD172 (a, b, g) CD174 CD177 CD178 CD179 (a, b) CD181 CD182 CD183 CD184 CD185 CD186 CD191 CD192 CD193 CD194 CD195 CD196 CD197 CDw198 CDw199 CD200
201-250	CD201 CD202b CD204 CD205 CD206 CD207 CD208 CD209 CDw210 (a, b) CD212 CD213a (1, 2) CD217 CD218 (a, b) CD220 CD221 CD222 CD223 CD224 CD225 CD226 CD227 CD228 CD229 CD230 CD233 CD234 CD235 (a, b) CD236 CD238 CD239 CD240CE CD240D CD241 CD243 CD244 CD246 CD247 CD248 CD249
251-300	CD252 CD253 CD254 CD256 CD257 CD258 CD261 CD262 CD263 CD264 CD265 CD266 CD267 CD268 CD269 CD270 CD271 CD272 CD273 CD274 CD275 CD276 CD278 CD279 CD280 CD281 CD282 CD283 CD284 CD286 CD288 CD289 CD290 CD292 CDw293 CD294 CD295 CD297 CD298 CD299
301-350	CD300A CD301 CD302 CD303 CD304 CD305 CD306 CD307 CD309 CD312 CD314 CD315 CD316 CD317 CD318 CD319 CD320 CD321 CD322 CD324 CD325 CD326 CD328 CD329 CD331 CD332 CD333 CD334 CD335 CD336 CD337 CD338 CD339 CD340 CD344 CD349 CD350
351-400	CD351 CD352 CD353 CD354 CD355 CD357 CD358 CD360 CD361 CD362 CD363 CD364 CD365 CD366 CD367 CD368 CD369 CD370 CD371