CLCA2

CLCA2
Ідентифікатори
Символи CLCA2, CACC, CACC3, CLCRG2, CaCC-3, chloride channel accessory 2
Зовнішні ІД OMIM: 604003 MGI: 2139758 HomoloGene: 4765 GeneCards: CLCA2
Шаблон експресії




Більше даних
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (мРНК)
NM_006536
NM_178697
RefSeq (білок)
NP_006527
NP_848812
Локус (UCSC) Хр. 1: 86.42 – 86.46 Mb Хр. 3: 144.78 – 144.81 Mb
PubMed search [1] [2]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей

CLCA2 (англ. Chloride channel accessory 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. [3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 943 амінокислот, а молекулярна маса — 103 941[4].

Послідовність амінокислот
1020304050
MTQRSIAGPICNLKFVTLLVALSSELPFLGAGVQLQDNGYNGLLIAINPQ
VPENQNLISNIKEMITEASFYLFNATKRRVFFRNIKILIPATWKANNNSK
IKQESYEKANVIVTDWYGAHGDDPYTLQYRGCGKEGKYIHFTPNFLLNDN
LTAGYGSRGRVFVHEWAHLRWGVFDEYNNDKPFYINGQNQIKVTRCSSDI
TGIFVCEKGPCPQENCIISKLFKEGCTFIYNSTQNATASIMFMQSLSSVV
EFCNASTHNQEAPNLQNQMCSLRSAWDVITDSADFHHSFPMNGTELPPPP
TFSLVQAGDKVVCLVLDVSSKMAEADRLLQLQQAAEFYLMQIVEIHTFVG
IASFDSKGEIRAQLHQINSNDDRKLLVSYLPTTVSAKTDISICSGLKKGF
EVVEKLNGKAYGSVMILVTSGDDKLLGNCLPTVLSSGSTIHSIALGSSAA
PNLEELSRLTGGLKFFVPDISNSNSMIDAFSRISSGTGDIFQQHIQLEST
GENVKPHHQLKNTVTVDNTVGNDTMFLVTWQASGPPEIILFDPDGRKYYT
NNFITNLTFRTASLWIPGTAKPGHWTYTLNNTHHSLQALKVTVTSRASNS
AVPPATVEAFVERDSLHFPHPVMIYANVKQGFYPILNATVTATVEPETGD
PVTLRLLDDGAGADVIKNDGIYSRYFFSFAANGRYSLKVHVNHSPSISTP
AHSIPGSHAMYVPGYTANGNIQMNAPRKSVGRNEEERKWGFSRVSSGGSF
SVLGVPAGPHPDVFPPCKIIDLEAVKVEEELTLSWTAPGEDFDQGQATSY
EIRMSKSLQNIQDDFNNAILVNTSKRNPQQAGIREIFTFSPQISTNGPEH
QPNGETHESHRIYVAIRAMDRNSLQSAVSNIAQAPLFIPPNSDPVPARDY
LILKGVLTAMGLIGIICLIIVVTHHTLSRKKRADKKENGTKLL

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, протеаз, металопротеаз. Задіяний у таких біологічних процесах як клітинна адгезія, транспорт іонів, транспорт, поліморфізм. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, іоном кальцію, хлоридом. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані, клітинних контактах. Також секретований назовні.

Література

[ред. | ред. код]
  • Agnel M., Vermat T., Culouscou J.-M. (1999). Identification of three novel members of the calcium-dependent chloride channel (CaCC) family predominantly expressed in the digestive tract and trachea. FEBS Lett. 455: 295—301. PMID 10437792 DOI:10.1016/S0014-5793(99)00891-1
  • Itoh R., Kawamoto S., Miyamoto Y., Kinoshita S., Okubo K. (2000). Isolation and characterization of a Ca(2+)-activated chloride channel from human corneal epithelium. Curr. Eye Res. 21: 918—925. PMID 11262615 DOI:10.1076/ceyr.21.6.918.6983
  • The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
  • Bustin S.A., Li S.-R., Dorudi S. (2001). Expression of the Ca2+-activated chloride channel genes CLCA1 and CLCA2 is downregulated in human colorectal cancer. DNA Cell Biol. 20: 331—338. PMID 11445004 DOI:10.1089/10445490152122442
  • Abdel-Ghany M., Cheng H.-C., Elble R.C., Pauli B.U. (2001). The breast cancer beta 4 integrin and endothelial human CLCA2 mediate lung metastasis. J. Biol. Chem. 276: 25438—25446. PMID 11320086 DOI:10.1074/jbc.M100478200
  • Connon C.J., Kawasaki S., Yamasaki K., Quantock A.J., Kinoshita S. (2005). The quantification of hCLCA2 and colocalisation with integrin beta4 in stratified human epithelia. Acta Histochem. 106: 421—425. PMID 15707651 DOI:10.1016/j.acthis.2004.08.003

Примітки

[ред. | ред. код]
  1. Human PubMed Reference:.
  2. Mouse PubMed Reference:.
  3. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:2016 (англ.) . Архів оригіналу за 11 березня 2016. Процитовано 28 серпня 2017.
  4. UniProt, Q9UQC9 (англ.) . Архів оригіналу за 20 жовтня 2016. Процитовано 28 серпня 2017.

Див. також

[ред. | ред. код]