PAX4 |
---|
|
Ідентифікатори |
---|
Символи | PAX4, KPD, MODY9, paired box 4 |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 167413 MGI: 97488 HomoloGene: 4515 GeneCards: PAX4 |
---|
|
Пов'язані генетичні захворювання |
---|
цукровий діабет 1-го типу, maturity-onset diabetes of the young type 9[1] |
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • DNA binding • sequence-specific DNA binding • GO:0001078, GO:0001214, GO:0001206 DNA-binding transcription repressor activity, RNA polymerase II-specific • double-stranded DNA binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific • GO:0001948, GO:0016582 protein binding |
---|
Клітинна компонента | • нуклеоплазма • клітинне ядро |
---|
Біологічний процес | • диференціація клітин • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • negative regulation of apoptotic process • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • transcription, DNA-templated • multicellular organism development • retina development in camera-type eye • циркадний ритм • positive regulation of cell differentiation • animal organ morphogenesis • регуляція диференціювання клітин • response to cAMP • GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated • endocrine pancreas development • pancreas development |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
|
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | |
---|
RefSeq (білок) | | |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 7: 127.61 – 127.62 Mb | Хр. 6: 28.44 – 28.45 Mb |
---|
PubMed search | [2] | [3] |
---|
Вікідані |
|
PAX4 (англ. Paired box 4) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 7-ї хромосоми.[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 350 амінокислот, а молекулярна маса — 37 833[5].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MHQDGISSMN | | QLGGLFVNGR | | PLPLDTRQQI | | VRLAVSGMRP | | CDISRILKVS |
NGCVSKILGR | | YYRTGVLEPK | | GIGGSKPRLA | | TPPVVARIAQ | | LKGECPALFA |
WEIQRQLCAE | | GLCTQDKTPS | | VSSINRVLRA | | LQEDQGLPCT | | RLRSPAVLAP |
AVLTPHSGSE | | TPRGTHPGTG | | HRNRTIFSPS | | QAEALEKEFQ | | RGQYPDSVAR |
GKLATATSLP | | EDTVRVWFSN | | RRAKWRRQEK | | LKWEMQLPGA | | SQGLTVPRVA |
PGIISAQQSP | | GSVPTAALPA | | LEPLGPSCYQ | | LCWATAPERC | | LSDTPPKACL |
KPCWDCGSFL | | LPVIAPSCVD | | VAWPCLDASL | | AHHLIGGAGK | | ATPTHFSHWP |
|
Кодований геном білок за функціями належить до репресорів, білків розвитку. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, диференціація клітин, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у ядрі.
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
|
---|
(1) Основні домени |
---|
(1.1) Лейцинова застібка (bZIP) | |
---|
(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH) | |
---|
(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP) | |
---|
(1.4) NF-1 | |
---|
(1.5) RF-X | |
---|
(1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH) | |
---|
|
|
(2) Цинк-координовані домени ДНК |
---|
(2.1)Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4) | підродина 1 | |
---|
підродина 2 | |
---|
підродина 3 | |
---|
підродина 4 | |
---|
підродина 5 | |
---|
підродина 6 | |
---|
підродина 0 | |
---|
|
---|
(2.2) Інші цинкові пальці Cys4 | |
---|
(2.3) Cys2His2 з доменом цинкових пальців | |
---|
(2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер | |
---|
(2.5) Цинкові пальці іншого складу | |
---|
(2.6) WRKY | |
---|
|
|
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль |
---|
(3.1) Гомеобокс | |
---|
(3.2) Парний бокс | |
---|
(3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль | |
---|
(3.4) Фактори теплового шоку | |
---|
(3.5) Триптофановий кластер | |
---|
(3.6) Домен транскрипційний енхансер | |
---|
|
|
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом |
---|
(4.1) RHR | |
---|
(4.2) STAT | |
---|
(4.3) p53 | |
---|
(4.4) MADS | |
---|
(4.6) TATA | |
---|
(4.7) Високомобільна група | |
---|
(4.9) Grainyhead | |
---|
(4.10) Домен холодового шоку | |
---|
(4.11) Runt | |
---|
|
|
(0) Інші фактори транскрипції |
---|
(0.2) HMGI(Y) | |
---|
(0.3) Pocket домен | |
---|
(0.5) AP2/EREBP-подібні | |
---|
(0.6) Інші | |
---|
|
|