YBX3

YBX3
Ідентифікатори
Символи	YBX3, CSDA, CSDA1, DBPA, ZONAB, Y-box binding protein 3
Зовнішні ІД	OMIM: 603437 MGI: 2137670 HomoloGene: 2708 GeneCards: YBX3
Онтологія гена
Молекулярна функція	• DNA binding; • RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding; • GO:0001106 transcription corepressor activity; • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity; • mRNA 3'-UTR binding; • single-stranded DNA binding; • GO:0001078, GO:0001214, GO:0001206 DNA-binding transcription repressor activity, RNA polymerase II-specific; • nucleic acid binding; • double-stranded DNA binding; • RNA binding; • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific; • GO:0001948, GO:0016582 protein binding; • polysome binding;
Клітинна компонента	• Полісома; • bicellular tight junction; • perinuclear region of cytoplasm; • клітинне ядро; • цитоплазма; • гіалоплазма;
Біологічний процес	• male gonad development; • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated; • negative regulation of intrinsic apoptotic signaling pathway in response to osmotic stress; • negative regulation of necroptotic process; • positive regulation of cytoplasmic translation; • cellular response to tumor necrosis factor; • positive regulation of organ growth; • negative regulation of apoptotic process; • in utero embryonic development; • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II; • transcription, DNA-templated; • cellular hyperosmotic response; • negative regulation of skeletal muscle tissue development; • Сперматогенез; • response to cold; • запліднення; • 3'-UTR-mediated mRNA stabilization;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	; ;
	Більше даних
Ортологи
	8531
	56449
	ENSG00000060138
	ENSMUSG00000030189
	P16989
	Q9JKB3
	NM_001145426; NM_003651
	NM_011733; NM_139117
	NP_001138898; NP_003642
	NP_035863; NP_620817
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

YBX3 (англ. Y-box binding protein 3) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 12-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 372 амінокислот, а молекулярна маса — 40 090^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MSEAGEATTT	TTTTLPQAPT	EAAAAAPQDP	APKSPVGSGA	PQAAAPAPAA
HVAGNPGGDA	APAATGTAAA	ASLATAAGSE	DAEKKVLATK	VLGTVKWFNV
RNGYGFINRN	DTKEDVFVHQ	TAIKKNNPRK	YLRSVGDGET	VEFDVVEGEK
GAEAANVTGP	DGVPVEGSRY	AADRRRYRRG	YYGRRRGPPR	NYAGEEEEEG
SGSSEGFDPP	ATDRQFSGAR	NQLRRPQYRP	QYRQRRFPPY	HVGQTFDRRS
RVLPHPNRIQ	AGEIGEMKDG	VPEGAQLQGP	VHRNPTYRPR	YRSRGPPRPR
PAPAVGEAED	KENQQATSGP	NQPSVRRGYR	RPYNYRRRPR	PPNAPSQDGK
EAKAGEAPTE	NPAPPTQQSS	AE

A: Аланін
 D: Аспарагінова кислота
 E: Глутамінова кислота
 F: Фенілаланін
 G: Гліцин
 H: Гістидин
 I: Ізолейцин
 K: Лізин
 L: Лейцин
 M: Метіонін
 N: Аспарагін
 P: Пролін
 Q: Глутамін
 R: Аргінін
 S: Серин
 T: Треонін
 V: Валін
 W: Триптофан
 
 Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до репресорів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

Sakura H., Maekawa T., Imamoto F., Yasuda K., Ishii S. (1988). Two human genes isolated by a novel method encode DNA-binding proteins containing a common region of homology. Gene. 73: 499—507. PMID 2977358 DOI:10.1016/0378-1119(88)90514-8
Kudo S., Mattei M.-G., Fukuda M. (1995). Characterization of the gene for dbpA, a family member of the nucleic-acid-binding proteins containing a cold-shock domain. Eur. J. Biochem. 231: 72—82. PMID 7628487 DOI:10.1111/j.1432-1033.1995.tb20672.x
Coles L.S., Diamond P., Occhiodoro F., Vadas M.A., Shannon M.F. (1996). Cold shock domain proteins repress transcription from the GM-CSF promoter. Nucleic Acids Res. 24: 2311—2317. PMID 8710501 DOI:10.1093/nar/24.12.2311
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504