TFCP2

TFCP2
Ідентифікатори
Символи	TFCP2, LBP1C, LSF, LSF1D, SEF, TFCP2C, transcription factor CP2
Зовнішні ІД	OMIM: 189889 MGI: 98509 HomoloGene: 4134 GeneCards: TFCP2
Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity; • DNA binding; • protein C-terminus binding; • GO:0001948, GO:0016582 protein binding; • sequence-specific DNA binding; • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific; • GO:0001158 cis-regulatory region sequence-specific DNA binding; • transcription factor binding; • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific; • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding;
Клітинна компонента	• нуклеоплазма; • гіалоплазма; • клітинне ядро; • GO:0009327 protein-containing complex;
Біологічний процес	• GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated; • transcription, DNA-templated; • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II; • mRNA transcription by RNA polymerase II; • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	; ;
	Більше даних
Ортологи
	7024
	21422
	ENSG00000135457
	ENSMUSG00000009733
	Q12800
	Q9ERA0
	NM_005653; NM_001173452; NM_001173453
	NM_001289603; NM_033476; NM_001355497
	NP_001166923; NP_001166924; NP_005644
	NP_001276532; NP_258437; NP_001342426
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

TFCP2 (англ. Transcription factor CP2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 12-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 502 амінокислот, а молекулярна маса — 57 256^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MAWALKLPLA	DEVIESGLVQ	DFDASLSGIG	QELGAGAYSM	SDVLALPIFK
QEESSLPPDN	ENKILPFQYV	LCAATSPAVK	LHDETLTYLN	QGQSYEIRML
DNRKLGELPE	INGKLVKSIF	RVVFHDRRLQ	YTEHQQLEGW	RWNRPGDRIL
DIDIPMSVGI	IDPRANPTQL	NTVEFLWDPA	KRTSVFIQVH	CISTEFTMRK
HGGEKGVPFR	VQIDTFKENE	NGEYTEHLHS	ASCQIKVFKP	KGADRKQKTD
REKMEKRTPH	EKEKYQPSYE	TTILTECSPW	PEITYVNNSP	SPGFNSSHSS
FSLGEGNGSP	NHQPEPPPPV	TDNLLPTTTP	QEAQQWLHRN	RFSTFTRLFT
NFSGADLLKL	TRDDVIQICG	PADGIRLFNA	LKGRMVRPRL	TIYVCQESLQ
LREQQQQQQQ	QQQKHEDGDS	NGTFFVYHAI	YLEELTAVEL	TEKIAQLFSI
SPCQISQIYK	QGPTGIHVLI	SDEMIQNFQE	EACFILDTMK	AETNDSYHII
LK

A: Аланін
 C: Цистеїн
 D: Аспарагінова кислота
 E: Глутамінова кислота
 F: Фенілаланін
 G: Гліцин
 H: Гістидин
 I: Ізолейцин
 K: Лізин
 L: Лейцин
 M: Метіонін
 N: Аспарагін
 P: Пролін
 Q: Глутамін
 R: Аргінін
 S: Серин
 T: Треонін
 V: Валін
 W: Триптофан
 
 Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

Lim L.C., Swendeman S.L., Sheffery M. (1992). Molecular cloning of the alpha-globin transcription factor CP2. Mol. Cell. Biol. 12: 828—835. PMID 1732747 DOI:10.1128/MCB.12.2.828
Yoon J.-B., Li G., Roeder R.G. (1994). Characterization of a family of related cellular transcription factors which can modulate human immunodeficiency virus type 1 transcription in vitro. Mol. Cell. Biol. 14: 1776—1785. PMID 8114710 DOI:10.1128/MCB.14.3.1776
Shirra M.K., Zhu Q., Huang H.-C., Pallas D., Hansen U. (1994). One exon of the human LSF gene includes conserved regions involved in novel DNA-binding and dimerization motifs. Mol. Cell. Biol. 14: 5076—5087. PMID 8035790 DOI:10.1128/MCB.14.8.5076
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Bing Z., Reddy S.A., Ren Y., Qin J., Liao W.S.-L. (1999). Purification and characterization of the serum amyloid A3 enhancer factor. J. Biol. Chem. 274: 24649—24656. PMID 10455131 DOI:10.1074/jbc.274.35.24649
Jane S.M., Nienhuis A.W., Cunningham J.M. (1995). Hemoglobin switching in man and chicken is mediated by a heteromeric complex between the ubiquitous transcription factor CP2 and a developmentally specific protein. EMBO J. 14: 97—105. PMID 7828600

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:11748 (англ.) . Процитовано 11 вересня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
↑ UniProt, Q12800 (англ.) . Архів оригіналу за 21 липня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 12

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

Портал «Біологія» Портал «Хімія»

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:11748 (англ.) . Процитовано 11 вересня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)

[UniProt-4] UniProt, Q12800 (англ.) . Архів оригіналу за 21 липня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.

[1]

[2]

[3]

[4]

TFCP2

Література

Примітки

Див. також

€4.95