PHOX2A |
---|
|
Ідентифікатори |
---|
Символи | PHOX2A, ARIX, CFEOM2, FEOM2, NCAM2, PMX2A, paired like homeobox 2a |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 602753 MGI: 106633 HomoloGene: 31296 GeneCards: PHOX2A |
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • DNA binding • sequence-specific DNA binding • RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific |
---|
Клітинна компонента | • клітинне ядро |
---|
Біологічний процес | • somatic motor neuron differentiation • parasympathetic nervous system development • regulation of respiratory gaseous exchange • dopaminergic neuron differentiation • noradrenergic neuron differentiation • locus ceruleus development • trochlear nerve formation • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • sympathetic nervous system development • oculomotor nerve formation • transcription, DNA-templated • midbrain development • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • нейробіологія розвитку • autonomic nervous system development • enteric nervous system development |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
|
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | |
---|
RefSeq (білок) | | |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 11: 72.24 – 72.25 Mb | Хр. 7: 101.47 – 101.47 Mb |
---|
PubMed search | [1] | [2] |
---|
Вікідані |
|
PHOX2A (англ. Paired like homeobox 2a) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 11-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 284 амінокислот, а молекулярна маса — 29 653[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MDYSYLNSYD | | SCVAAMEASA | | YGDFGACSQP | | GGFQYSPLRP | | AFPAAGPPCP |
ALGSSNCALG | | ALRDHQPAPY | | SAVPYKFFPE | | PSGLHEKRKQ | | RRIRTTFTSA |
QLKELERVFA | | ETHYPDIYTR | | EELALKIDLT | | EARVQVWFQN | | RRAKFRKQER |
AASAKGAAGA | | AGAKKGEARC | | SSEDDDSKES | | TCSPTPDSTA | | SLPPPPAPGL |
ASPRLSPSPL | | PVALGSGPGP | | GPGPQPLKGA | | LWAGVAGGGG | | GGPGAGAAEL |
LKAWQPAESG | | PGPFSGVLSS | | FHRKPGPALK | | TNLF |
Кодований геном білок за функцією належить до активаторів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у ядрі.
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
|
---|
(1) Основні домени |
---|
(1.1) Лейцинова застібка (bZIP) | |
---|
(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH) | |
---|
(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP) | |
---|
(1.4) NF-1 | |
---|
(1.5) RF-X | |
---|
(1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH) | |
---|
|
|
(2) Цинк-координовані домени ДНК |
---|
(2.1)Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4) | підродина 1 | |
---|
підродина 2 | |
---|
підродина 3 | |
---|
підродина 4 | |
---|
підродина 5 | |
---|
підродина 6 | |
---|
підродина 0 | |
---|
|
---|
(2.2) Інші цинкові пальці Cys4 | |
---|
(2.3) Cys2His2 з доменом цинкових пальців | |
---|
(2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер | |
---|
(2.5) Цинкові пальці іншого складу | |
---|
(2.6) WRKY | |
---|
|
|
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль |
---|
(3.1) Гомеобокс | |
---|
(3.2) Парний бокс | |
---|
(3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль | |
---|
(3.4) Фактори теплового шоку | |
---|
(3.5) Триптофановий кластер | |
---|
(3.6) Домен транскрипційний енхансер | |
---|
|
|
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом |
---|
(4.1) RHR | |
---|
(4.2) STAT | |
---|
(4.3) p53 | |
---|
(4.4) MADS | |
---|
(4.6) TATA | |
---|
(4.7) Високомобільна група | |
---|
(4.9) Grainyhead | |
---|
(4.10) Домен холодового шоку | |
---|
(4.11) Runt | |
---|
|
|
(0) Інші фактори транскрипції |
---|
(0.2) HMGI(Y) | |
---|
(0.3) Pocket домен | |
---|
(0.5) AP2/EREBP-подібні | |
---|
(0.6) Інші | |
---|
|
|