SIM1

SIM1
Ідентифікатори
Символи	SIM1, bHLHe14, single-minded family bHLH transcription factor 1, SIM bHLH transcription factor 1
Зовнішні ІД	OMIM: 603128 MGI: 98306 HomoloGene: 3715 GeneCards: SIM1
Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity; • DNA binding; • protein dimerization activity; • protein heterodimerization activity; • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific;
Клітинна компонента	• клітинне ядро;
Біологічний процес	• GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II; • multicellular organism development; • диференціація клітин; • ureteric bud development; • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated; • transcription, DNA-templated; • нейробіологія розвитку;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	Більше даних
Ортологи
	6492
	20464
	ENSG00000112246
	ENSMUSG00000019913
	P81133
	Q61045
	NM_005068; NM_001374769
	NM_011376
	NP_005059; NP_001361698
	NP_035506
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

SIM1 (англ. Single-minded family bHLH transcription factor 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 6-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 766 амінокислот, а молекулярна маса — 85 515^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MKEKSKNAAR	TRREKENSEF	YELAKLLPLP	SAITSQLDKA	SIIRLTTSYL
KMRVVFPEGL	GEAWGHSSRT	SPLDNVGREL	GSHLLQTLDG	FIFVVAPDGK
IMYISETASV	HLGLSQVELT	GNSIYEYIHP	ADHDEMTAVL	TAHQPYHSHF
VQEYEIERSF	FLRMKCVLAK	RNAGLTCGGY	KVIHCSGYLK	IRQYSLDMSP
FDGCYQNVGL	VAVGHSLPPS	AVTEIKLHSN	MFMFRASLDM	KLIFLDSRVA
ELTGYEPQDL	IEKTLYHHVH	GCDTFHLRCA	HHLLLVKGQV	TTKYYRFLAK
HGGWVWVQSY	ATIVHNSRSS	RPHCIVSVNY	VLTDTEYKGL	QLSLDQISAS
KPAFSYTSSS	TPTMTDNRKG	AKSRLSSSKS	KSRTSPYPQY	SGFHTERSES
DHDSQWGGSP	LTDTASPQLL	DPADRPGSQH	DASCAYRQFS	DRSSLCYGFA
LDHSRLVEER	HFHTQACEGG	RCEAGRYFLG	TPQAGREPWW	GSRAALPLTK
ASPESREAYE	NSMPHIASVH	RIHGRGHWDE	DSVVSSPDPG	SASESGDRYR
TEQYQSSPHE	PSKIETLIRA	TQQMIKEEEN	RLQLRKAPSD	QLASINGAGK
KHSLCFANYQ	QPPPTGEVCH	GSALANTSPC	DHIQQREGKM	LSPHENDYDN
SPTALSRISS	PNSDRISKSS	LILAKDYLHS	DISPHQTAGD	HPTVSPNCFG
SHRQYFDKHA	YTLTGYALEH	LYDSETIRNY	SLGCNGSHFD	VTSHLRMQPD
PAQGHKGTSV	IITNGS

A: Аланін
 C: Цистеїн
 D: Аспарагінова кислота
 E: Глутамінова кислота
 F: Фенілаланін
 G: Гліцин
 H: Гістидин
 I: Ізолейцин
 K: Лізин
 L: Лейцин
 M: Метіонін
 N: Аспарагін
 P: Пролін
 Q: Глутамін
 R: Аргінін
 S: Серин
 T: Треонін
 V: Валін
 W: Триптофан
 
 Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до білків розвитку. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, диференціація клітин, нейрогенез. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

Yamaki A., Kudoh J., Shimizu N., Shimizu Y. (2004). A novel nuclear localization signal in the human single-minded proteins SIM1 and SIM2. Biochem. Biophys. Res. Commun. 313: 482—488. PMID 14697214 DOI:10.1016/j.bbrc.2003.11.168