SP1

SP1
Наявні структури
PDBПошук ортологів: PDBe RCSB
Ідентифікатори
Символи SP1, entrez:6667, Sp1 transcription factor
Зовнішні ІД OMIM: 189906 MGI: 98372 HomoloGene: 8276 GeneCards: SP1
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (мРНК)
NM_001251825
NM_003109
NM_138473
NM_013672
RefSeq (білок)
NP_001238754
NP_003100
NP_612482
NP_038700
Локус (UCSC) Хр. 12: 53.38 – 53.42 Mb Хр. 15: 102.31 – 102.34 Mb
PubMed search [1] [2]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей

SP1 (англ. Sp1 transcription factor) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 12-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 785 амінокислот, а молекулярна маса — 80 693[4].

Послідовність амінокислот
1020304050
MSDQDHSMDEMTAVVKIEKGVGGNNGGNGNGGGAFSQARSSSTGSSSSTG
GGGQESQPSPLALLAATCSRIESPNENSNNSQGPSQSGGTGELDLTATQL
SQGANGWQIISSSSGATPTSKEQSGSSTNGSNGSESSKNRTVSGGQYVVA
AAPNLQNQQVLTGLPGVMPNIQYQVIPQFQTVDGQQLQFAATGAQVQQDG
SGQIQIIPGANQQIITNRGSGGNIIAAMPNLLQQAVPLQGLANNVLSGQT
QYVTNVPVALNGNITLLPVNSVSAATLTPSSQAVTISSSGSQESGSQPVT
SGTTISSASLVSSQASSSSFFTNANSYSTTTTTSNMGIMNFTTSGSSGTN
SQGQTPQRVSGLQGSDALNIQQNQTSGGSLQAGQQKEGEQNQQTQQQQIL
IQPQLVQGGQALQALQAAPLSGQTFTTQAISQETLQNLQLQAVPNSGPII
IRTPTVGPNGQVSWQTLQLQNLQVQNPQAQTITLAPMQGVSLGQTSSSNT
TLTPIASAASIPAGTVTVNAAQLSSMPGLQTINLSALGTSGIQVHPIQGL
PLAIANAPGDHGAQLGLHGAGGDGIHDDTAGGEEGENSPDAQPQAGRRTR
REACTCPYCKDSEGRGSGDPGKKKQHICHIQGCGKVYGKTSHLRAHLRWH
TGERPFMCTWSYCGKRFTRSDELQRHKRTHTGEKKFACPECPKRFMRSDH
LSKHIKTHQNKKGGPGVALSVGTLPLDSGAGSEGSGTATPSALITTNMVA
MEAICPEGIARLANSGINVMQVADLQSINISGNGF

Кодований геном білок за функціями належить до репресорів, активаторів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як взаємодія хазяїн-вірус, транскрипція, регуляція транскрипції, біологічні ритми, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, ДНК. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

[ред. | ред. код]
  • The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
  • Takahara T., Kanazu S., Yanagisawa S., Akanuma H. (2000). Heterogeneous Sp1 mRNAs in human HepG2 cells include a product of homotypic trans-splicing. J. Biol. Chem. 275: 38067—38072. PMID 10973950 DOI:10.1074/jbc.M002010200
  • Kadonaga J.T., Carner K.R., Masiarz F.R., Tjian R. (1987). Isolation of cDNA encoding transcription factor Sp1 and functional analysis of the DNA binding domain. Cell. 51: 1079—1090. PMID 3319186 DOI:10.1016/0092-8674(87)90594-0
  • Jackson S.P., Tjian R. (1988). O-glycosylation of eukaryotic transcription factors: implications for mechanisms of transcriptional regulation. Cell. 55: 125—133. PMID 3139301 DOI:10.1016/0092-8674(88)90015-3
  • Courey A.J., Tjian R. (1988). Analysis of Sp1 in vivo reveals multiple transcriptional domains, including a novel glutamine-rich activation motif. Cell. 55: 887—898. PMID 3142690 DOI:10.1016/0092-8674(88)90144-4
  • Wang L., Mukherjee S., Jia F., Narayan O., Zhao L.J. (1995). Interaction of virion protein Vpr of human immunodeficiency virus type 1 with cellular transcription factor Sp1 and trans-activation of viral long terminal repeat. J. Biol. Chem. 270: 25564—25569. PMID 7592727 DOI:10.1074/jbc.270.43.25564

Примітки

[ред. | ред. код]
  1. Human PubMed Reference:.
  2. Mouse PubMed Reference:.
  3. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:11205 (англ.) . Процитовано 11 вересня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
  4. UniProt, P08047 (англ.) . Архів оригіналу за 17 серпня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.

Див. також

[ред. | ред. код]